International interlaboratory study to normalize liquid chromatography-based mycotoxin retention times through implementation of a retention index system
Notice bibliographique
Résumé
• Evaluation of N-alkylpyridinium-3-sulfonates (NAPS) retention index (RI) system for mycotoxins. • Participation of 24 expert laboratories in interlaboratory study providing 44 method datasets. • NAPS RI supported retention time (t R ) normalization. • Participant RI data supported t R prediction. • Anchoring and Tanimoto structural similarity coefficients are suitable to improve t R . Monitoring for mycotoxins in food or feed matrices is necessary to ensure the safety and security of global food systems. Due to a lack of standardized methods and individual laboratory priorities, most institutions have developed their own methods for mycotoxin determinations. Given the diversity of mycotoxin chemical structures and physicochemical properties, searching databases, and comparing data between institutions is complicated. We previously introduced incorporating a retention index (RI) system into liquid chromatography mass spectrometry (LC-MS) based mycotoxin determinations. To validate this concept, we designed an interlaboratory study where each participating laboratory was sent N-alkylpyridinium-3-sulfonates (NAPS) RI standards, and 36 mycotoxin standards for analysis using their pre-optimized LC-MS methods. Data from 44 analytical methods were submitted from 24 laboratories representing various manufacturer platforms, LC columns, and mobile phase compositions. Mycotoxin retention times (t R ) were converted to RI values based on their elution relative to the NAPS standards. Trichothecenes (deoxynivalenol, 3-acetyldeoxynivalenol, 15-acetyldeoxynivalenol) showed t R consistency (± 20–50 RI units, 1–5 % median RI) regardless of mobile phase or type of chromatography column in this study. For the remaining mycotoxins tested, the RI values were strongly impacted by the mobile phase composition and column chemistry. The ability to predict t R was evaluated based on the median RI mycotoxin values and the NAPS t R . These values were corrected using Tanimoto coefficients to investigate whether structurally similar compounds could be used as anchors to further improve accuracy. This study demonstrated the power of employing an RI system for mycotoxin determinations, further enhancing the confidence of identifications.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,096 | 0,052 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,005 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,002 |
| Communication savante | 0,003 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,004 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».