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Enregistrement W4406923528 · doi:10.1093/ofid/ofae631.2067

P-1906. Early COVID-19 and Severity of Subsequent Omicron Infection in Ontario, Canada

2025· article· en· W4406923528 sur OpenAlexaffabout
Caroline Kassee, Moe H. Kyaw, Zoë Zhong, Altynay Shigayeva, Catherine Martin, Lubna Farooqi, Brenda L. Coleman, Wayne L. Gold, Christopher Kandel, Maria Major, Samira Mubareka, Srinivas Rao Valluri, John M. McLaughlin, Allison McGeer

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCOVID-19 Clinical Research Studies
Établissements canadiensHealth Sciences CentreSunnybrook Health Science CentrePfizer (Canada)Toronto East General HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)2019-20 coronavirus outbreakVirologyInternal medicineOutbreakDiseaseInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background As SARS-CoV-2 evolves, assessing changes in COVID-19 severity over time, and the impact of prior infection on repeat infection, is important. We determined whether developing COVID-19 early in the pandemic was associated with reduced severity of subsequent infection with Omicron sub-lineages. Methods We evaluated COVID-19 severity among patients infected during the Omicron wave. Severity was measured in 3 ways:(1) an ordinal measure combining activities of daily living (ADL) and presence of fever,(2) healthcare required (yes/no),(3) an ordinal measure of illness duration. We compared these outcomes in a study of age and time-period matched cohorts in Toronto, Canada: one with symptomatic COVID-19 between Mar 1 & Sep 30/2020 ('early COVID-19') and another who did not test positive for SARS-CoV-2 during the same period. Participants completed baseline, then biweekly surveys to identify SARS-CoV-2 infection episodes from Jan 2020 to Jan 2023. Multivariable binary and ordinal logistic regression models were used to construct ORs and 95% CI for impact of early COVID-19 on severity, adjusted for social/demographic characteristics, comorbidities, COVID-19 vaccination status, and time from early COVID-19 to first Omicron infection. Results Of 261 participants with COVID-19 due to Omicron (Table 1), 177 had early COVID-19 at a median of 26 months prior. In adjusted analyses, those with early COVID-19 occurring < 24 months prior to their Omicron infection had lower odds of having severe Omicron-related illness; OR 0.35 (95%CI 0.15-0.80); with non-significant lower odds of requirement for healthcare (OR 0.49,95%CI 0.14-1.8) and illness duration (OR 0.80, 95%CI 0.32-2.0) (Table 2). Immunocompromise was associated with more severe illness based on all 3 outcomes; other non-immunocompromising comorbidities were associated with requiring healthcare and longer illness duration, and females reported longer illness duration (Table 2). Conclusion Developing COVID-19 early in the pandemic was associated with reduced severity of first Omicron infection if it occurred < 24 months later. Immunocompromise and the presence of other underlying comorbidities were associated with increased severity, and women reported longer duration of illness. Disclosures Moe H. Kyaw, PhD, Pfizer: Employee Catherine Martin, PhD, Pfizer: employee|Pfizer: Stocks/Bonds (Private Company) Maria Major, B.Sc., M.P.H., Pfizer: Employee Samira Mubareka, MD, Pfizer: Grant/Research Support Srinivas Valluri, PhD, Pfizer: Employee John M. McLaughlin, PhD, Pfizer: Employee|Pfizer: Stocks/Bonds (Public Company) Allison McGeer, MD, AstraZeneca: Honoraria|GSK: Honoraria|Merck: Honoraria|Moderna: Honoraria|Novavax: Honoraria|Pfizer: Grant/Research Support|Pfizer: Honoraria|Roche: Honoraria|Seqirus: Grant/Research Support|Seqirus: Honoraria

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,173

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,369
Écart entre enseignants0,344 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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