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Enregistrement W4406924121 · doi:10.1093/ofid/ofae631.2462

P-2310. <i>Gammaproteobacteria</i> Load Responses in the Intestinal Microbiota of Patients Undergoing Hematopoietic Cell Transplantation Predicts Resistant Gram-Negative Rod Colonization

2025· article· en· W4406924121 sur OpenAlexaffabout
Leanne Mortimer, Nicole Janusz, Amanda C Carroll, Austin Yan, Tamara Leite, Andrew Purssell, Natasha Kekre, Michael Kennah, C. Arianne Buchan, Derek R. MacFadden

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeutropenia and Cancer Infections
Établissements canadiensOttawa HospitalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésColonizationMedicineGammaproteobacteriaHematopoietic cellTransplantationGramHematopoietic stem cell transplantationHaematopoiesisDysbiosisImmunologyMicrobiologyGut floraInternal medicineBiologyBacteriaStem cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Hematopoietic cell transplant (HCT) patients are at high risk of Gram-negative rod (GNR) blood stream infections (BSIs) particularly before pre-engraftment. Globally, breakthrough infections with resistant GNRs (rGNRs) are increasing in HCT while rGNR epidemiology has become increasingly complex to predict. It’s recognized that individualized antimicrobial HCT therapy is needed but it is unclear what screening strategies are optimal to detect rGNR colonization. Single taxon dominance of certain Gammaproteobacteria (ɣ-bacteria) species in HCT intestinal microbiomes is a BSI risk factor where colonizing strains present prior to transplant are predominant aetiologies of GNR BSIs. In this study we sought to understand how ɣ-bacteria loads respond to HCT antimicrobial therapy. Methods We performed a prospective study of 60 adult patients undergoing HCT at The Ottawa Hospital from 2021-2022. A baseline fecal sample collected &amp;lt; 1 week before conditioning was screened by culture for colonization with rGNR to fluoroquinolones (FQ), 3rd generation cephalosporins (3GC) and carbapenems. Total- and ɣ-bacteria loads were measured by qPCR in baseline and serial specimens until engraftment, expressed as the Log10 (ɣ-bacteria 16S copies / total 16S copies) per ng fecal DNA. Ceftriaxone (CTX) and piperacillin-tazobactam (TZP) are used for prophylaxis and empiric FN therapy, respectively at our institution. Results High ɣ-bacteria loads were associated with baseline rGNR colonization compared to no rGNR colonization (Log10 (-1.85) vs Log10 (-2.39), p &amp;lt; 0.0095) (Fig. 1). Highest loads occurred when resistant Escherichia coli or Klebsiella pneumoniae colonized the intestinal microbiota (Log10 (-1.34), p &amp;lt; 0.001). ɣ-bacteria loads were refractory to CTX and TZP therapy when colonizing E. coli or K. pneumoniae carried 3GC resistance (Fig. 2a). In contrast, ɣ-bacteria loads decreased &amp;gt; 2 Log10 in response to CTX and TZP if at baseline rGNRs were FQ resistant, expressed chromosomal AmpC, or if no rGNRs were detected (Fig. 2b, c, d). Conclusion ɣ-bacteria load measurement during HCT may be useful for predicting colonization with rGNR strains and identifying patients at risk of GNR BSI. Disclosures All Authors: No reported disclosures

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,605

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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