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Enregistrement W4406924221 · doi:10.1093/ofid/ofae631.2207

P-2051. Assessing SARS-CoV-2 Correlates Protection from Exposed Household Members: A Prospective Cohort Study (AB-PROTECT Study)

2025· article· en· W4406924221 sur OpenAlexaffabout
Christopher Kandel, Maureen Taylor, Karen Colwill, Queenie Hu, Andrea Llanes, Gloria Crowl, Helen Elliott, Angel Li, Maxime Lefebvre, Yaejin Lee, Alexandra Kurtesi, Freda Qi, Melanie Delgado-Brand, Tulunay Tursun, Geneviève Mailhot, Robert W. Kozak, Janine McCready, Jeff Powis, Anne‐Claude Gingras, Allison McGeer

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineEconomics, Econometrics and Finance
ThématiqueCOVID-19 Pandemic Impacts
Établissements canadiensSinai Health SystemSunnybrook Health Science CentreToronto East General HospitalUniversity of TorontoMount Sinai HospitalHealth Sciences CentreLunenfeld-Tanenbaum Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineProspective cohort studySevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Coronavirus disease 2019 (COVID-19)Cohort studyCohort2019-20 coronavirus outbreakGerontologyFamily medicineEnvironmental healthVirologyInternal medicineOutbreakDiseaseInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background The protection afforded by COVID-19 vaccination wanes over time and varies by SARS-CoV-2 strain. Identifying a marker to serve as an immunologic correlate of protection (CoP) is crucial to ensure future vaccine iterations are sufficiently protective and to inform recommendations for the timing of subsequent vaccine doses.Figure 1.Antibody titres.The probability of COVID-19 by log transformed anti-Spike and anti-RBD IgG titres with raw values represented by dots. Methods A prospective cohort of asymptomatic adults exposed to a household member with COVID-19 was created in Toronto, Ontario from October 1, 2021 until February 21, 2023. At enrolment, anti-spike and anti-receptor binding domain (RBD) IgG titres were measured as were pseudoneutralization titres against wild-type, BA.1 and BA.5 strains for those who provided serum. Participants were followed for 28 days with molecular or antigen testing performed if COVID-19 symptoms arose. A convalescent DBS was collected to assess for asymptomatic infection to compare acute and convalescent anti-nucleoprotein IgG titres. The probability of contracting COVID-19 was modeled using a binomial generalized additive model with a logit link and a thin plate spline on log transformed antibody titres adjusted for whether mitigation measures were employed.Figure 2.Pseudoneutralization Titres.The probability of COVID-19 by log transformed SARS-CoV-2 wild-type pseudoneutralization antibody titres for the entire cohort and households with a circulating Omicron variant. Results In total, 432 individuals from 311 households participated, of which 210 developed COVID-19. The median age was 43 (interquartile range 38-50), 67% (288/432) received 3 vaccine doses, 65% (280/432) were a parent of the index case and 51% (222/432) employed a mitigation measure. There was no difference in the probability of infection by Spike or RBD titres (Figure 1). The difference in probability of COVID for Spike IgG between the 90th (8.83) and 10th percentiles (5.76) is 1.01 (95% CI 0.9 - 1.15, p = 0.84). For RBD IgG the difference between 90th (8.17) and 10th percentiles (5.27) is 1.01 (95% CI 0.89 - 1.14, p = 0.87). Wild-type pseudoneutralization titres also did not confer protection (Figure 2). No differences were identified by circulating household SARS-CoV-2 variant or by pseudoneutralization strain. Conclusion Vaccine derived immune markers of asymptomatic household contacts do not correlate with protection against COVID-19. This could be due to the nonexistence of humoral correlates, rapid rise in antibody titres during the pre-symptomatic phase, or changes in behaviour overrides immune protection. Disclosures Allison McGeer, MD, AstraZeneca: Honoraria|GSK: Honoraria|Merck: Honoraria|Moderna: Honoraria|Novavax: Honoraria|Pfizer: Grant/Research Support|Pfizer: Honoraria|Roche: Honoraria|Seqirus: Grant/Research Support|Seqirus: Honoraria

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,041
Score d'incertitude au seuil0,082

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,305
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
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