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Enregistrement W4406929468 · doi:10.6000/1927-520x.2024.13.20

Identification of Tyrosinase Gene Polymorphisms Associated with Albinism in Swamp and Riverine Types of Water Buffaloes (Bubalus bubalis Linn.) in the Philippines

2024· article· en· W4406929468 sur OpenAlexvenueno aff
Melinda R. Bacual, E.N. Bacual, Carlito F. Dela Cruz, Mercedes García, Maria Genaleen Q. Diaz, Ester B. Flores

Notice bibliographique

RevueJournal of Buffalo Science · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBubalusAlbinismSwampBiologyTyrosinaseWater buffaloGeneIdentification (biology)GeneticsVeterinary medicineBotanyBiochemistryMedicineEcologyEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Albinism is a genetic condition marked by a lack of melanin in the skin, hair, and eyes, leading to increased sensitivity to light and susceptibility to skin cancer. Oculocutaneous albinism in buffaloes is caused by a G>A mutation in the tyrosinase gene, which introduces a premature stop codon, rendering the enzyme inactive. Despite efforts to prevent genetic defects, albinism persists because it is an autosomal recessive trait. This study used capillary sequencing to analyze the tyrosinase gene in local buffaloes. Methods: One hundred forty-eight (148) buffaloes were sampled for genomic DNA extraction, followed by PCR amplification of the reported region of the tyrosinase gene with G>A mutation associated with albinism. The PCR products were subjected to Sanger chain termination sequencing. Genotypic frequencies were computed manually, and phenotypic association was done descriptively. Results: The proportion of phenotypically albino-looking buffaloes was 4.76% of the sampled animals and are homozygous for the A allele of the G>A mutation at position 1494 of the tyrosinase gene. These were all riverine-type buffaloes. Phenotypically white but with pigmented irises were all swamp buffaloes and comprised 4.17% of the sampled animals. All swamp buffaloes sampled, including the phenotypically white with pigmented irises, were homozygous for the G allele of the G>A mutation at position 1494, suggesting these are not similar cases of oculocutaneous albinism. Conclusions: The study established baseline data on the prevalence of albinism and identified new mutations in the tyrosinase gene for further research on their effects on color phenotypes and production potential.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,300
Score d'incertitude au seuil0,176

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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