Evaluating vitamin C-related gene-environment and metabolite-environment interaction effects on intraocular pressure in the Canadian Longitudinal Study on Aging
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
High intraocular pressure (IOP) is an important risk factor for glaucoma, which is influenced by genetic and environmental factors. However, the etiology of high IOP remains uncertain. Metabolites are compounds involved in metabolism which provide a link between the internal (genetic) and external environments. O-methylascorbate has been reported to be associated with IOP. In addition, researchers have identified several genetic variants which are associated with metabolite concentrations, including O-methylascorbate and another vitamin C related metabolite, ascorbic acid 2-sulfate. We aimed to understand how O-methylascorbate and ascorbic acid 2-sulfate, or genetic variants associated with these metabolites, modify the associations between dietary environmental variables and IOP. We used data from 8060 participants of the Canadian Longitudinal Study on Aging. Using linear models adjusted for relevant covariates, we tested for interactions between six genetic variants previously found to be associated with O-methylascorbate and ascorbic acid 2-sulfate and four environmental variables related to diet (alcohol consumption frequency, smoking status, fruit consumption, and vegetable consumption). We also tested for interactions between serum concentrations of O-methylascorbate and ascorbic acid 2-sulfate and these environmental factors. We used a False Discovery Rate approach to correct for the 32 interaction tests performed. One interaction was suggestively significant after multiple testing correction (adjusted P-value < 0.1): rs8050812 and alcohol consumption frequency. Understanding how genetic variants and metabolites interact with the environment could shed light on biological pathways controlling IOP and lead to improved prevention and treatment of glaucoma.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle