P-1023. Prevalence and distribution of fungal microorganisms among cutaneous specimens submitted to community microbiology laboratories
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Not much is known about the local prevalence of cutaneous fungal infections in Canada because these data are not readily available. Knowing the distribution of microorganisms in local settings may help developing guidance for empiric therapy, especially for immunocompromised patients whose cutaneous fungal infections could turn into systemic infections. The current retrospective study aimed to establish the prevalence and distribution of fungal microorganisms among patients who had specimens submitted to community microbiology laboratory for cutaneous fungal culture workups. Methods LifeLabs regional microbiology laboratories, connected with 129 collection centers in urban and rural communities in British Columbia, provided reports of isolated fungus from hair, nail, and skin scraping specimens from 1 January 2022 to 31 December 2022. Culture followed by microscopy and/or MALDI-TOF mass spectrometry was routinely used to isolate and identity microorganisms, but nucleic-acid testing was added to help identification if needed. Results Among the 20652 cutaneous specimens submitted in a year, 3665 of them were reported to have microorganism growth. The most reported microorganism was Trichophyton species (43.8%), followed by Penicillium species (5.8%), Candida albicans (4.2%), Aspergillus species (3.6%), and Fusarium species (2.8%). Of note, other than Trichophyton species, the other two main dermatophytes Microsporum species and Epidermophyton species accounted for only 0.2% and 0.1% of the positive specimens, respectively. Pseudomonas aeruginosa was incidentally identified in 2.9% of the positive specimens in the fungal culture workups. Conclusion Trichophyton species was the most reported microorganism among the hair, nail, and skin scrapping specimens submitted for cutaneous fungal culture workups from communities in British Columbia. Pseudomonas infections, which could present as chloronychia, folliculitis, ecthyma gangrenosum, could be considered in the differential diagnoses of cutaneous fungal infections. The current data will help clinicians to determine the empiric therapy needed based on each patient’s clinical situation. Disclosures All Authors: No reported disclosures
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».