P-2360. Wastewater-Based Surveillance of Hepatitis A Virus Across Communities in Alberta, Canada
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Hepatitis A virus (HAV) incident infection in Canada is rarely diagnosed (i.e. incidence of 3.6-10 cases/100,000 persons) (PMID: 18159360). Infections generally relate to imported contaminated food-products, or travelers returning from endemic countries. Due to its fecal-oral spread, possible underdiagnosis, and often-cryptic presentation, HAV is an ideal candidate for wastewater (WW)-based surveillance, a tool increasingly utilized to monitor infectious diseases globally.Figure 1.Longitudinal monitoring of HAV RNA wastewater abundance across eight Alberta municipalities over a 4-month period. Methods 24-hour composite WW was collected weekly from eight geographically disparate, and socioeconomically diverse municipal WW treatment plants in Alberta from August to December 2023. After short-term cold storage, WW was centrifuged, and RNA from the raw pellet was extracted using Qiagen’s RNeasy PowerFecal pro. HAV levels were quantified by RT-qPCR of the vp1 gene. 2021 Canadian census data was used to define population demographics for each participating site. Results HAV was detected in 18/117 (15.4%) WW samples and 5/8 (62.5%) municipalities over the 4-month period (Figure 1). RNA abundance in HAV positive WW samples was a median of 3.4 copies/mL (IQR 0.44 - 6.97). Larger population size (p=0.007), and greater density (p=0.001) were associated with increased likelihood of HAV WW detection, whereas social and economic demographics of populations within sewershed catchments did not associate with likelihood of HAV detection (Table 1). Conclusion HAV RNA is rarely detected in the wastewater of Alberta. Detection was more frequently observed in larger municipalities, which is consistent with non-endemic, imported disease. WW surveillance can potentially be adapted to monitor HAV in the context of outbreaks to reduce secondary transmission, and safeguard public health. Disclosures Mark Swain, MD MSc, Abbott: Advisor/Consultant|Advanz: Advisor/Consultant|Gilead, BMS, CymaBay, Intercept, Genfit, Pfizer, Novartis, Astra Zeneca, GSK, Celgene, Novo Nordisk, Axcella Health Inc., Merck, Galectin Therapeutics: Grant/Research Support|GSK: Advisor/Consultant|Ipsen: Advisor/Consultant|Novo Nordisk: Advisor/Consultant Carla Coffin, MD MSc, Altimmune: Grant/Research Support|Gilead: Grant/Research Support|GSK: Grant/Research Support|Janssen: Grant/Research Support Steven J. Drews, PhD FCCM D(ABMM), Abbott: Grant/Research Support|Danaher: Honoraria|Roche: Advisor/Consultant|Roche: Grant/Research Support
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».