Specific modulation of 28S_Um2402 rRNA 2′-<i>O</i>-ribose methylation as a novel epitranscriptomic marker of ZEB1-induced epithelial–mesenchymal transition in different mammary cell contexts
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The epithelial–mesenchymal transition (EMT) is a dynamic transdifferentiation of epithelial cells into mesenchymal cells. EMT programs exhibit great diversity, based primarily on the distinct impact of molecular activities of the EMT transcription factors. Using a panel of cancer cell lines and a series of 71 triple-negative primary breast tumors, we report that the EMT transcription factor ZEB1 modulates site-specific chemical modifications of ribosomal RNA (rRNA). Overexpression of ZEB1 and ZEB2, but not TWIST1, decreased the level of 2′-O-ribose methylation (2′Ome) of 28S rRNA at position Um2402. ZEB1 overexpression specifically reduced the expression of the corresponding C/D box small nucleolar RNAs (snoRNAs) SNORD143/144, which guide the rRNA 2′Ome complex at the 28S_Um2402 site. During ZEB1-induced EMT induction/reversion, the levels of both 2′Ome at 28S_Um2402 and SNORD143/144 were dynamically comodulated. Taken together, these data demonstrate that 2′Ome rRNA epitranscriptomics is a novel marker of ZEB1-induced EMT.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».