Candidate DNA and RNA viruses of Drosophila suzukii from Canada and Germany, and their interactions with Wolbachia
Notice bibliographique
Résumé
Spotted wing Drosophila (Photo by Warren H. L. Wong) • 8 and 2 candidate RNA and DNA viruses were found in British Columbia Drosophila suzukii ; all but one are newly reported. • Teise virus, a single-stranded positive sense RNA viruses was abundant. • There was not a strong association between infection with Wolbachia bacterial symbionts and Teise virus. Some species of insects harbour strains of the endosymbiotic bacteria Wolbachia that do not cause obvious reproductive manipulations, and so it is unclear why they persist in host populations. There is some evidence that some of these endosymbionts may provide their hosts with protection against viruses, which would help to explain their persistence, but few studies have explored associations between Wolbachia and naturally occurring, common viruses in natural populations. Here, we asked whether individuals of the invasive vinegar fly Drosophila suzukii infected with the wSuz strain of Wolbachia were less likely to be infected by naturally occurring viruses in its invaded range, in western North America and in Europe. First, using next-generation sequencing, we conducted a virome survey of adult and larval D. suzukii in British Columbia, Canada, finding eight candidate RNA viruses and two candidate DNA viruses; all but one have not been reported previously. Only the previously described Teise virus, an RNA virus, was abundant in our virome survey. We then screened individual flies from British Columbia and Germany for Teise virus and Wolbachia . Wolbachia -infected D. suzukii from the field were not less likely to be infected by Teise virus. Overall, our results do not provide conclusive evidence that wSuz provides strong protection for D. suzukii against viruses that are common in natural populations. However, the other viruses that we discovered in this study deserve further characterization in terms of their pathogenicity to D. suzukii and the frequency and dynamics of infection in wild populations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».