MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4406985565 · doi:10.1183/13993003.01618-2024

Accelerated epigenetic ageing worsens survival and mediates environmental stressors in fibrotic interstitial lung disease

2025· article· en· W4406985565 sur OpenAlexaffabout
G.C. Goobie, Daniel-Costin Marinescu, Ayodeji Adegunsoye, Jean Bourbeau, Chris Carlsten, Rachel L. Clifford, Dany Doiron, Qing Duan, Kevin F. Gibson, Amanda Grant-Orser, Ana I. Hernández Cordero, Kerri A. Johannson, Daniel J. Kass, Sharon E. Kim, Janice M. Leung, Xiaoyun Li, Wan C. Tan, Chen Xi Yang, Mehdi Nouraie, Christopher J. Ryerson, Tillie‐Louise Hackett, Yingze Zhang

Notice bibliographique

RevueEuropean Respiratory Journal · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInterstitial Lung Diseases and Idiopathic Pulmonary Fibrosis
Établissements canadiensVancouver Coastal Health Research InstituteVancouver Coastal HealthUniversity of CalgaryMcGill UniversityUniversity of British Columbia HospitalMcGill University Health CentreVancouver General HospitalUniversity of British ColumbiaQueen's UniversitySt. Paul's Hospital
Organismes subventionnairesBoehringer Ingelheim
Mots-clésMedicineInterquartile rangeEpigeneticsCohortInternal medicineProportional hazards modelOncologyGeneticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background The role of epigenetic ageing in the environmental pathogenesis and prognosis of fibrotic interstitial lung disease (fILD) is unclear. We evaluated whether ambient particulate matter with diameter ≤2.5 μm (PM2.5) and neighbourhood disadvantage exposures are associated with accelerated epigenetic ageing, and whether epigenetic age is associated with adverse clinical outcomes in patients with fILD. Methods This multicentre, international, cohort study included patients with fILD from the University of Pittsburgh (UPitt, n=306) and University of British Columbia (UBC, n=170). 5-year PM2.5exposures were estimated using satellite-derived hybrid models. Neighbourhood disadvantage was calculated using US and Canadian census-based metrics. Epigenetic age difference (EAD=epigenetic age−chronological age) was calculated using GrimAge analysis of blood DNA methylation data. Linear models assessed associations of exposures with EAD. Cox models assessed associations of EAD with transplant-free survival. Causal mediation analysis evaluated EAD mediation of exposure–survival relationships. Results Median epigenetic age was 11.7 years older than chronological age in patients with fILD. In combined cohort analysis, each interquartile range (IQR) increase in PM2.5was associated with 2.88 years (95% CI 1.39–4.38; p<0.001) increased EAD. In UPitt, each IQR neighbourhood disadvantage increase was associated with 1.16 years (95% CI 0.22–2.09; p=0.02) increased EAD. Increased EAD was associated with worse transplant-free survival (hazard ratio 1.17 per 1-year increase in EAD, 95% CI 1.10–1.24; p<0.001), with EAD mediating 40% of the PM2.5–survival relationship and 59% of the neighbourhood disadvantage–survival relationship. Epigenetic age was also more strongly associated with transplant-free survival than chronological age. Conclusions Epigenetic age acceleration is associated with worse survival and mediates adverse exposure impacts in fILD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueEuropean Respiratory JournalMême sujetInterstitial Lung Diseases and Idiopathic Pulmonary FibrosisTravaux en français237 207