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Enregistrement W4406992003 · doi:10.1242/jeb.249641

Evolutionary insights into gut acidification: invertebrate-like mechanisms in the basal vertebrate hagfish

2025· article· en· W4406992003 sur OpenAlexafffund
Alyssa M. Weinrauch, Garfield T. Kwan, Marina Giacomin, Ian A. Bouyoucos, Martín Tresguerres, Greg G. Goss

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Biology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueOcean Acidification Effects and Responses
Établissements canadiensUniversity of ManitobaBamfield Marine Sciences CentreUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNSF Center for Synthetic Organic Electrochemistry, University of UtahCompany of BiologistsNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaWellcome TrustUniversity of AlbertaNational Science Foundation
Mots-clésHagfishBiologyVertebrateDigestion (alchemy)Cell biologyBiochemistryGeneChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Acidification is a key component of digestion throughout metazoans. The gut digestive fluid of many invertebrates is acidified by the vesicular-type H+-ATPase (VHA). In contrast, vertebrates generate acidic gut fluids using the gastric H+/K+-ATPase (HKA), an evolutionary innovation linked with the appearance of a true stomach that greatly improves digestion, absorption and immune function. Hagfishes are the most basal extant vertebrates, and their mechanism of digestive acidification remains unclear. Herein, we report that the stomachless Pacific hagfish (Eptatretus stoutii) acidify their gut using the VHA, and searches of E. stoutii gut transcriptomes and the genome of a closely related hagfish species (E. burgerii) indicate they lack HKA, consistent with its emergence following the 2R whole-genome duplication. Immunostaining revealed prominent VHA presence in the apical membrane of enterocytes and sub-apical expression of both VHA and soluble adenylyl cyclase. Interestingly, akin to vertebrates, VHA was also observed in immature pancreatic-like zymogen granules and was noticeably absent from the mature granules. Furthermore, isolated gut sacs from fed hagfish demonstrate increased VHA-dependent luminal H+ secretion that is stimulated by the cAMP pathway. Overall, these results suggest that the hagfish gut shares the trait of VHA-dependent acidification with invertebrates, while simultaneously performing some roles of the pancreas and intestine of gnathostomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,549
Score d'incertitude au seuil0,440

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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