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Enregistrement W4407039737 · doi:10.3390/curroncol32020080

Molecular Tumor Board-Guided Targeted Treatments for Biliary Tract Cancers in a Publicly Funded Healthcare System

2025· article· en· W4407039737 sur OpenAlexafffundvenueabout
Felix E.G. Beaudry, Zhihao Li, Ayelet Borgida, Anudari Zorigtbaatar, Xin Wang, Oumaima Hamza, Gun Ho Jang, Roxana Dana Bucur, Anna Dodd, Julie M. Wilson, Rebecca C. Auer, Samuel D. Saibil, Erica S. Tsang, Arndt Vogel, Grainne M. O’Kane, Steven Gallinger, Jennifer J. Knox, Faiyaz Notta, Gonzalo Sapisochín, Robert C. Grant

Notice bibliographique

RevueCurrent Oncology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCholangiocarcinoma and Gallbladder Cancer Studies
Établissements canadiensInstitute for Clinical Evaluative SciencesUniversity of TorontoUniversity Health NetworkToronto General HospitalOttawa HospitalPrincess Margaret Cancer CentreOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesTerry Fox Research InstituteEisaiNateraAstraZenecaGovernment of OntarioPrincess Margaret Cancer FoundationStryker
Mots-clésMedicineBiliary tract cancerTargeted therapyOncologyInternal medicineHealth careHealthcare systemClinical OncologyCancerIntensive care medicineBioinformaticsGemcitabine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Comprehensive molecular profiling can identify alterations in biliary tract cancer (BTC) potentially treatable with targeted therapies. However, the impact of whole-genome and transcriptome sequencing (WGTS) on therapeutic decision-making in a public healthcare system is unknown. Here, BTC patients prospectively received WGTS to inform clinical care at a large Canadian academic cancer center. We characterized the proportion of targetable alterations, the treatment recommendations generated by a molecular tumor board, targeted therapies received, patient outcomes, and the financing of these treatments. A total of 55 patients with BTC prospectively underwent WGTS to inform clinical care. Of those 55, 28 (51%, 95% CI 38-64%) harbored targetable alterations. Molecular tumor boards recommended consideration of targeted therapies for 43 (78% CI: 66-87%) of 55 cases. Among the 15 patients who progressed to second-line therapy and harbored targetable alterations, 8 received nine targeted therapies. No targeted therapies were funded through the public system, and most therapies were funded through compassionate access programs from companies. These results highlight the challenges and potential for inequities when implementing precision oncology in a publicly funded healthcare system.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,022
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,723
Score d'incertitude au seuil0,556

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,022
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,004
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,097
Tête enseignante GPT0,418
Écart entre enseignants0,321 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission4
Résumé présentoui

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