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Enregistrement W4407131690 · doi:10.22541/au.173868021.17467578/v1

Population divergence in the eastern North American boreal forests: Extensive gene flow and genetic swamping characterize the Palm Warbler subspecies hybrid zone (Parulidae: Setophaga palmarum )

2025· preprint· en· W4407131690 sur OpenAlexaff
G. Yoo, Jason T. Weir

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensThe Scarborough HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésWarblerGene flowSubspeciesDivergence (linguistics)PalmEcologyBiologyBorealPopulationTaigaGenetic divergenceGeographyHabitatGenetic variationGeneGenetic diversityDemographyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

not-yet-known not-yet-known not-yet-known unknown Pleistocene glaciations have shaped much of the population divergence events in the coniferous forests of North America. However, while the evidence for forest fragmentation and population divergence associated with glacial cycles is well-established in western North America, whether glaciation has served a similar role in the boreal forests of eastern North America is unclear. Here, we present the first analyses for an avian hybrid zone in boreal eastern North America between two subspecies of Palm Warblers (Setophaga palmarum). Using both genomic and plumage datasets, we characterize the divergence history of the two subspecies and relate our findings to the larger biogeographic patterns in the region. The Palm Warbler subspecies diverged in the Pleistocene (around 775 KYA) and appears to have experienced near-continuous gene flow since initial splitting with little evidence for reproductive isolation. Demographic modelling indicates that following divergence, the western subspecies expanded eastwards in breeding range and displaced the genetic ancestry of its eastern counterpart, resulting in the current hybrid zone. The timing and patterns of divergence for the Palm Warbler subspecies is largely congruent with the sole other known case of avian divergence in the region, which likely reflects a shared biogeographic history involving multiple eastern boreal refugia. However, the apparent ongoing collapse of the Palm Warbler subspecies post-divergence suggests that the differentiation generated through these eastern refugia were likely not sufficient in establishing strong reproductive isolation, which perhaps explain why speciation events have been relatively rare in the eastern boreal forests of North America.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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