Stress Granule Sequestration of CCR4–NOT Promotes Poly(A) Lengthening of Stress-Survival Transcripts
Notice bibliographique
Résumé
Cells adapt to stress by rewiring their post-transcriptional gene regulation. Stress granules-biomolecular condensates composed of polyadenylated RNAs and RNA-binding proteins-are implicated in this process, yet their precise functional roles remain debated. To address this, we mapped the dynamic proteomic landscapes of stress granules formed under oxidative and hyperosmotic stress using multi-bait BioID proximity profiling coupled with quantitative mass spectrometry. This analysis revealed context-specific remodeling of proximal interaction networks and identified a conserved, stress-dependent shift in association with the CCR4-NOT deadenylase complex. A complementary genome-wide chemical genetic screen further implicated CCR4-NOT in stress granule biology, showing that reduced CCR4-NOT activity bypassed lipoamide-mediated inhibition of stress granule assembly. Microscopy showed sequestration of the CCR4-NOT complex into stress granules, and global transcriptomic analyses revealed that this relocalization promotes poly(A) tail lengthening and increased abundance of stress-induced survival transcripts. Together, integration of proteomics, chemical genetics, and transcriptomics uncovers a spatial mechanism by which stress granule assembly promotes cellular adaptation to stress through sequestration of CCR4-NOT from the cytosol and consequent remodeling of post-transcriptional regulation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».