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Enregistrement W4407176041 · doi:10.1002/cam4.70640

Retrospective Study of Genetic Testing Results Reveals Pathogenic Variants Beyond <scp>BRCA1</scp>/2 in Hereditary Breast and Ovarian Cancer Cases in New Brunswick: Implications for Future Care

2025· article· en· W4407176041 sur OpenAlexafffundabout
Kelly Gauvin, Véronique Allain, Nadia Bouhamdani, Chloe Williams, Yanis Saheb, Lynn Macrae, Katherine Hodson, Yun Amber Zhu, Éric P. Allain, Mouna Ben Amor

Notice bibliographique

RevueCancer Medicine · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensWSP (Canada)Université de MonctonAtlantic Cancer Research InstituteVitalité Health NetworkMoncton HospitalUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesFondation de la recherche en santé du Nouveau-BrunswickBeatrice Hunter Cancer Research InstituteCancer Research Institute
Mots-clésBreast cancerGeneticsCHEK2Founder effectPopulationCancerGenetic testingBiologyAlleleOvarian cancerGeneMedicineMutationHaplotypeGermline mutation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: In Canada, founder variants in breast cancer susceptibility genes have been identified in populations residing in Québec and Newfoundland, thus demonstrating the value in characterizing the genetic profile of local populations for better clinical management. New Brunswick has a diverse, yet genetically unexplored population that includes founder Irish and Acadian ancestry, among others, and we hypothesized that this population could demonstrate potential enrichments for variants in breast cancer genes. METHODS: Health records were retrospectively analyzed for 445 cases referred to the genetics clinic in Moncton, New Brunswick, their molecular results were summarized and compared to allele frequencies from similar studies in Canada. RESULTS: No ethnic or age-related correlation for specific variants could be identified. However, BRCA1/2 variant frequency was lower than expected in the study group and variants in other susceptibility genes such as ATM and CHEK2 were higher when compared to similar studies. PERSPECTIVES: This study demonstrates a distinct profile in hereditary breast cancer genetics in a previously uncharacterized population, thus adding to existing knowledge of population genetics in Atlantic Canada.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,105
Score d'incertitude au seuil0,995

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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