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Enregistrement W4407181957 · doi:10.1002/cam4.70422

Genetic Characterization of the Immortalized Human Nasopharyngeal Carcinoma Cell Line <scp>NPC</scp>/<scp>HK1</scp>

2025· article· en· W4407181957 sur OpenAlexfundno aff
Anna Makowska, Udo Kontny, Josef van Helden, Barbara Hildebrandt, Herdit M. Schüler, Ralf Weiskirchen

Notice bibliographique

RevueCancer Medicine · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHead and Neck Cancer Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitut Gustave-RoussyNational Taiwan University HospitalChinese University of Hong KongNational Taiwan UniversityUniversity of Toronto
Mots-clésNasopharyngeal carcinomaCell cultureComputational biologyBiologyGenotypingBioinformaticsGeneticsGeneMedicineInternal medicineGenotypeRadiation therapy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Human nasopharyngeal carcinoma (NPC) cell lines are in vitro model systems that are widely available, easy to handle, and provide an unlimited supply of material. They also bypass ethical concerns associated with the use of primary human cells or tissue. However, many of these cell lines including 5-8F, 6-10B, CNE-1, CNE-2, HNE-1, HONE-1, SUNE1, SUNE2, and NPC-TW01 have been shown to be misidentified or cross-contaminated. While simple molecular genotyping techniques such as short tandem repeat profiling of human cell lines are available to confirm cell line identity, scientists often do not implement strategies to avoid misidentification. This has resulted in a large volume of publications containing incorrect information. METHODS: In this paper, we have established a cell line karyogram that contains several marker chromosomes and a set of typical aberrations characteristic of NPC/HK1. RESULTS AND CONCLUSIONS: Combined with the typical multiloci short tandem repeat signature of NPC/HK1, the cytogenetic analysis provides an effective means to avoid unreliable experimental outcomes and scientific misinterpretation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,636
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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