Fission yeast cells deficient in siderophore biosynthesis require Str2 for ferrichrome-dependent growth
Notice bibliographique
Résumé
Ferrichrome (Fc) acquisition in Schizosaccharomyces pombe is mediated by the cell-surface siderophore-iron transporter Str1. Here, we report that Str2, a protein homologous to Str1, localizes to the vacuolar membrane. Like Str1, Str2 expression is transcriptionally regulated in response to changes in iron concentrations. Both the str2+ and str1+ genes are induced under low-iron conditions and are repressed by the iron-responsive GATA-type transcription factor Fep1 when iron is abundant. Under high-iron conditions, chromatin immunoprecipitation (ChIP) assays reveal that TAP-Fep1 occupies the str2+ and str1+ promoters. Isolated vacuoles from str2Δ fep1Δ cells expressing GFP-tagged Str2 exhibit iron accumulation in vacuoles upon exposure to exogenous holo-Fc. sib1Δ sib2Δ cells deficient in Fc biosynthesis and lacking the str2+ gene (str2Δ) are unable to grow in the presence of exogenous Fc as a sole source of iron. Further analysis identified that conserved amino acids Tyr539 and Tyr553 in the last predicted loop of Str2 are required for supporting Fc-dependent growth of a sib1Δ sib2Δ mutant strain. Collectively, these findings indicate that the vacuolar Str2 protein plays a role in the consumption of Fc as an iron source, while also revealing the involvement of the vacuole in iron release from exogenous Fc after its assimilation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».