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Enregistrement W4407225465 · doi:10.3389/fmicb.2025.1527727

Fission yeast cells deficient in siderophore biosynthesis require Str2 for ferrichrome-dependent growth

2025· article· en· W4407225465 sur OpenAlexafffund
Berthy Mbuya, Samuel Plante, Tobias Vahsen, Ariane Brault, Simon Labbé

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Microbiology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFungal and yeast genetics research
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésSiderophoreFerrichromeYeastBiologyMicrobiologyBiosynthesisCell biologyChemistryBiochemistryBacteriaGeneticsGeneEscherichia coli

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ferrichrome (Fc) acquisition in Schizosaccharomyces pombe is mediated by the cell-surface siderophore-iron transporter Str1. Here, we report that Str2, a protein homologous to Str1, localizes to the vacuolar membrane. Like Str1, Str2 expression is transcriptionally regulated in response to changes in iron concentrations. Both the str2+ and str1+ genes are induced under low-iron conditions and are repressed by the iron-responsive GATA-type transcription factor Fep1 when iron is abundant. Under high-iron conditions, chromatin immunoprecipitation (ChIP) assays reveal that TAP-Fep1 occupies the str2+ and str1+ promoters. Isolated vacuoles from str2Δ fep1Δ cells expressing GFP-tagged Str2 exhibit iron accumulation in vacuoles upon exposure to exogenous holo-Fc. sib1Δ sib2Δ cells deficient in Fc biosynthesis and lacking the str2+ gene (str2Δ) are unable to grow in the presence of exogenous Fc as a sole source of iron. Further analysis identified that conserved amino acids Tyr539 and Tyr553 in the last predicted loop of Str2 are required for supporting Fc-dependent growth of a sib1Δ sib2Δ mutant strain. Collectively, these findings indicate that the vacuolar Str2 protein plays a role in the consumption of Fc as an iron source, while also revealing the involvement of the vacuole in iron release from exogenous Fc after its assimilation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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