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Enregistrement W4407250083 · doi:10.1101/2025.02.05.25321753

A genome-wide association study identified 10 novel genomic loci associated with intrinsic capacity

2025· preprint· en· W4407250083 sur OpenAlexafffundabout
Melkamu Bedimo Beyene, Renuka Visvanathan, Robel Alemu, Beben Benyamin, Rudrarup Bhattacharjee, Habtamu B. Beyene, Olga Theou, Matteo Cesari, John Beard, Azmeraw T. Amare

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchNational Health and Medical Research CouncilGovernment of Canada
Mots-clésGenome-wide association studyGeneticsBiologyGenomeComputational biologySingle-nucleotide polymorphismGeneGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract In 2015, the World Health Organization introduced the concept of intrinsic capacity (IC), a composite of all the physical and mental attributes that contribute to healthy aging. While substantial evidence supports the biological basis of IC and its subdomains, the extent of genetic influence on IC remains largely unexplored, with no studies currently available. Understanding the genetic basis of IC is crucial to advancing our knowledge and identifying interventions that promote healthy aging. To investigate the genetic basis of IC, we used data from the UK Biobank (UKB; N=44,631) and the Canadian longitudinal study on aging (CLSA; N=13,085). We estimated SNP-based heritability (h 2 SNP ) at 25.2% in UKB and 19.5% in CLSA. A Genome-Wide Association Study (GWAS) identified 38 independent SNPs for IC across 10 genomic loci and 4,289 candidate SNPs, mapped to 197 genes. Post-GWAS analysis revealed the role of these genes on cellular processes such as cell proliferation, immune function, metabolism, and neurodegeneration, with high expressions in muscle, heart, brain, adipose, and tibial nerve tissues. Of the 52 traits tested, 23 showed significant genetic correlations with IC, and a higher genetic loading for IC was associated with higher IC scores. This study is the first to identify genetic variants and pathways associated with IC, providing a foundation for future research on healthy aging.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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