A72 INFLUENCE OF THE MICROBIOME ON DENDRITIC CELL FUNCTION
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background The intestinal microbiome educates the immune system, in part through signaling in antigen- presenting cells including dendritic cells (DCs). Germ-free mice exhibit DC deficiency, migration impairment, and priming dysfunction, implying a relationship between microbiota and DC function. Naturally acquired, endemic Helicobacter species (H. spp.) such as H. hepaticus are common in many mouse colonies, whereas some facilities are Helicobacter-free. Aims Although they do not cause overt disease in most immune-competent mouse strains, we hypothesized that H. spp. could be a source of low-level inflammation, resulting in immune reprogramming and leading to phenotypic differences between H. spp.-positive and H. spp.- negative mice. Methods We generated bone marrow-derived dendritic cells (BMDCs) from H. spp.-positive mice and from genetically identical mice rendered H. spp.-free through mouse rederivation. BMDCs were stimulated for 6 hours (or not) with ultra-pure lipopolysaccharide (LPS). We measured expression of molecules MHC-I and MHC II (Signal 1 of antigen presentation) and CD80, CD86 and PD-L1 (Signal 2), the “activating” epigenetic mark of trimethylation at lysine 3 of histone 4 (H3K4me3) and metabolic changes via flow cytometry. Multiplex ELISA was used to measure secreted cytokines (Signal 3) and in vitro methods were used to assay BMDC antigen presentation. Bulk RNA sequencing of BMDCs was performed to further understand microbiome-linked changes in BMDC phenotype. Results Surface expression of molecules related to Signal 1 and Signal 2 of antigen presentation were increased both at steady state and after LPS stimulation in BMDCs derived from H. spp.-positive in comparison with H. spp.-free mice and this correlated with the abundance of H3K4me3. The presence or absence of H. spp. also altered metabolic phenotype of BMDCs upon LPS stimulation. Conclusions The presence of Helicobacter in the gut microbiome influences BMDC phenotype and may alter BMDC function. We anticipate epigenetic changes involved in BMDC phenotypic and functional changes, which will require in-depth epigenetic profiling. Future directions also include fecal microbiota transplant experiments and Helicobacter infection models followed by BMDC characterization using our established pipeline. Funding Agencies None
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».