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Enregistrement W4407285232 · doi:10.1093/jcag/gwae059.027

A27 THE IMPACT OF MICROBIAL-DERIVED METABOLITES ON TYPE III INTERFERON SIGNALING IN INTESTINAL EPITHELIAL CELLS

2025· article· en· W4407285232 sur OpenAlexaffabout
Testimony Olumade, Corinna Lantin, Yulia Fedorova, Robert E. Nelson, Olamide Ogungbola, Olga Fedorova, Michael Bording‐Jorgensen, Heather Armstrong, D Santer

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHelicobacter pylori-related gastroenterology studies
Établissements canadiensUniversity of WaterlooUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInterferonMicrobiologyChemistryBiologyCell biologyImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Interferons (IFNs) are key cytokines that protect mucosal barriers. There are three types – types I, II and III. Unlike types I and II, which are pro-inflammatory, type III interferons (IFN-λs) are highly expressed in the gut and exert beneficial effects such as mucosal healing and dampening inflammation in mouse colitis models. Gut microbes can directly induce IFN-λ expression and prior studies have shown that microbial-derived metabolites can upregulate IFN-λ activity in the lungs. However, much less is known about the role of gut microbial-derived metabolites in the regulation of IFN-λ activity in the gut. Aims We hypothesized that specific gut microbial-derived metabolites upregulate IFN-λ activity in human gut epithelial cells. Methods Caco-2 cells were pre-treated for 2 hours with anaerobic whole microbe secretions (1-10% v/v) and microbial-derived metabolites, including short-chain fatty acids (SCFAs; acetate, butyrate, and propionate), a metabolic intermediate (succinate), and a tryptophan metabolite (kynurenine). Next, cells were treated with or without IFN-λ3 (20-50ng/ml) for 22 hours (n=3 biological repeats). IFN-stimulated genes (ISGs; MX1 and IFIT1) were quantified by RT-qPCR. IFN-λR1 levels were quantified by flow cytometry. Results Out of microbe secretions added from four gut microbes thus far, secretions from one pathobiont inhibited IFN-λ activity. All SCFAs tested had a concentration-dependent inhibitory effect on IFN-λ3 induction of ISGs (MX1 and IFIT1; p<0.05). Succinate and kynurenine did not affect ISG induction by IFN-λ3 at any concentration tested. Only specific metabolites affected surface IFN-λR1 levels on Caco-2 cells. Conclusions Our findings demonstrate that specific microbial-derived metabolites can regulate intestinal IFN-λ immune responses. Contrary to our hypothesis, some metabolites can downregulate IFN-λ activity. Knowledge from this study provides fundamental knowledge about IFN-λ regulation in the human gut with implications for how to promote optimal IFN-λ activity to promote gut health, such as in inflammatory bowel diseases. Funding Agencies Children’s Hospital Research Institute of Manitoba, University of Manitoba

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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