Chromosome-level genomes of two Bracteacoccaceae highlight adaptations to biocrusts
Notice bibliographique
Résumé
Biological soil crusts (biocrusts) cover the majority of the world's dryland ground and are a significant component of the vegetation-free surface of the planet. They consist of an intimate association of microbial organisms, lichens, bryophytes and fungi. Biocrusts are severely endangered by anthropogenic disturbances despite their importance. The genus Bracteacoccus (Sphaeropleales, Chlorophyta) is a ubiquitous component of biocrusts from extreme environments. Here, we present the chromosome-level genome sequences of two Bracteacoccus species, B. bullatus and B. minor. Genome comparisons with other Archaeplastida identify genomic features that highlight the adaptation of these algae to abiotic stresses prevailing in such environments. These features include horizontal gene transfer events mainly from bacteria or fungi, gains and expansions of stress-related gene families, neofunctionalization of genes following gene duplications and genome structural variations. We also summarize transcriptional and metabolic responses of the lipid pathway of B. minor, based on multi-omics analyses, which is important for balancing the flexible conversion of polar membrane lipids and non-polar storage lipids to cope with various abiotic stresses. Under dehydration and high-temperature stress conditions B. minor differs considerably from other eukaryotic algae. Overall, these findings provide insights into the genetic basis of adaptation to abiotic stress in biocrust algae.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».