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Prognostic and Clinicopathological Significance of Centrosomal Protein 55 in Different Cancers: A Meta and Bioinformatic Analysis

2023· article· en· W4407306830 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Regulators and Homeostatic Agents/Journal of Biological Regulators & Homeostatic Agents · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrotubule and mitosis dynamics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMeta-analysisOncologyBiologyComputational biologyMedicineCancer researchPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Centrosomal protein 55 ( Cep55 ) is a mitogenic phosphoprotein that moves from the centrosome to the midbody of the cell and contributes to dislodging during late mitosis. It cooperates with the constituents of the intrasomal sorting complex, extracts the endosomal sorting complex required for transport (ESCRT) machinery, and promotes intercellular bridges contraction. Many studies have claimed an association between Cep55 expression and clinical performance prognosis. To verify this claim, a meta-analysis and bioinformatics analysis was performed to assess Cep55 prognostic and clinicopathological significance. Objective: The purpose of this study was to determine Cep55 prognostic value in neoplasms by analyzing the relationship between its expression and neoplasia patients clinico-prognosis. Methods: A meta-analysis and bioinformatics analysis was performed. Relevant studies were extracted from Pubmed, Embase, Cochrane Library, Web of Science, TCGA (The Cancer Genome Atlas) and GEO (Gene Expression Omnibus) databases using an appropriate search strategy. Quality of studies was evaluated by Newcastle-Ottawa Quality Weighted Assessment Scale (NOS). Meta-analysis was performed using the Stata 15.1 MP (multiprocessor) software (StataCorp company, College Station, TX, USA). Next, bioinformatics analysis was conducted to evaluate Cep55 expression in cancer patients. Cep55 expression data were retrieved from the Oncomine and GEPIA2 (Gene Expression Profiling Interactive Analysis 2) databases to compare Cep55 expression in dissimilar types of cancer and their relative health counterparts. Moreover, the association between Cep55 expression and the outcome of different carcinomas was evaluated. Results: A total of 11 studies involving 1535 cancer patients were included in the meta-analysis. Survival analysis showed that high Cep55 expression was associated with poor overall survival in patients with cancer (hazard ratio (HR): 1.58, 95% CI (confidence interval): 1.28–1.95, I 2 = 0%, p = 0.589). Bioinformatic analyses indicated that high Cep55 expression was associated with prognosis in patients with different tumors. Conclusions: Cep55 may be used as a potential prognostic biomarker for the identification of patients with tumors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,010
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,033

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,010
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0060,021
Bibliométrie0,0120,015
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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