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Enregistrement W4407349145 · doi:10.1002/biot.202400648

Methods for Eluting Intact Extracellular Vesicles From Aptamer‐Based Affinity Chromatography: A Critical Evaluation Based on Downstream Applications

2025· review· en· W4407349145 sur OpenAlexafffund
Lian Miller, Manjusri Misra, Huiyan Li

Notice bibliographique

RevueBiotechnology Journal · 2025
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueExtracellular vesicles in disease
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Guelph
Mots-clésElutionAptamerExtracellular vesiclesOligonucleotideChemistryChromatographyNucleic acidComputational biologyBiochemistryBiologyDNAMolecular biologyCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Extracellular vesicles (EVs) are nanosized vesicles released by cells, containing molecular cargo such as proteins and nucleic acids. EVs offer promising avenues for the detection of biomarkers of disease and are excellent candidates for drug delivery and therapeutics. Although EVs can be obtained from biological fluids, it is challenging to obtain intact EVs from complex fluids and there is no universally accepted standard method of isolating EVs. When affinity chromatography-based isolation is used to isolate EVs from complex biofluids, there exist multiple ways to elute intact EVs from capture. This review aims to identify effective EV elution methods for preserving EV integrity and bioactivity after capture on aptamer-functionalized substrates, addressing the requirements of various downstream applications. We hypothesize that when used for elution, different materials and techniques influence the characteristics of EVs, such as their molecular content and bioactivity. The elution reagent and technique must be selected for the intended application for isolated EVs. However, currently, there is no agreement on the optimal elution method for EVs. This literature review aims to evaluate the different methods used to elute intact EVs from capture with regards to the downstream applications of isolated EVs. Based on the results of our analysis of recent literatures, the two elution reagents that are optimal for general purposes of the eluted intact EVs are deoxyribonuclease I and complementary oligonucleotides, as they both preserve EV characteristics that are required for molecular analysis and bioactivity, such as maintained morphology and protein profiles.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,415
Écart entre enseignants0,375 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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