MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4407349156 · doi:10.1111/mec.17670

The Idiot's Guide to Effective Population Size

2025· review· en· W4407349156 sur OpenAlexaboutno aff
Robin S. Waples

Notice bibliographique

RevueMolecular Ecology · 2025
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIdiotRelevance (law)BiologyData sciencePopulationConstruct (python library)Effective population sizeComputer scienceGenetic diversitySociology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT This is a reference manual for the elegant, yet hideously complex concept of effective population size ( N e ), inspired by a classic, self‐published manual of automotive repair ‘for the compleat idiot’. The Guide is timely, given the recent Kunming‐Montreal Global Biodiversity Framework, where 196 Parties committed to tracking genetic diversity—and estimating N e —for all species. N e is a human construct, but a useful one that allows us to capture diverse aspects of an organism's biology in a single number. The Guide collates in one location factual information about effective population size, with a focus on topics of practical relevance to scientists and managers studying real populations; it covers definition, computation and estimation of effective size, both demographically and genetically. As appropriate, the reader is directed to other primary sources for more details. A ‘Don't Do These Things’ section lists several ill‐advised approaches to dealing with N e , and an Appendix provides useful tools and practical suggestions for interested users. A special section considers both possibilities and challenges presented by the genomics revolution. Availability of vast numbers of genetic markers increases precision, but less than some might think, and simultaneously introduces new challenges involving filtering and bioinformatics processing. As annotated genomes become more common for non‐model species, opportunities are opened to address qualitatively different questions, including reconstructing historical changes in N e through time.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,978
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations62
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMolecular EcologyMême sujetGenetic diversity and population structureTravaux en français237 207