Cellular Activity of CQWW Nullomer-Derived Peptides
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Analysis of observed protein sequences across all species within the UniProtKB/Swiss-Prot data set reveals CQWW as the shortest absent stretch of amino acids. While DNA can be found encoding the CQWW sequence, it has never been observed to be translated or included in manually curated sets of proteins, existing only in predicted, tentative sequences and in a single mature antibody sequence. We have synthesized this “nullomer” peptide, along with 13 derivatives, reversed, truncated, stereoisomers, and alanine-scanning peptides, conjugated to polyarginine stretches to increase cellular uptake. We observed their impact against a healthy neuronal line and six patient-derived glioblastoma cell lines spanning three clinical subtypes. Results reveal IC50 values averaging 4.9 μM for inhibition of cell survival across tested oncogenic cell lines. High-content phenotypic analysis of cellular features and reverse-phase protein arrays failed to discern a clear mode of action for the nullomer peptide but suggests mitochondrial impairment through the inhibition of GSK3 and isoforms, supported by observations of reduced mitochondrial stain intensities. With a recent increase in interest in nullomer peptides, we see the results in this study as a starting point for further investigation into this potentially therapeutic peptide class.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».