MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4407416554 · doi:10.29271/jcpsp.2025.02.203

Exploring Metabolomic Drivers of Colorectal and Gastric Cancer: A Mendelian Randomisation Study

2025· article· en· W4407416554 sur OpenAlexaboutno aff
Yiming Wang, Mi Jian, Jinchen Hu

Notice bibliographique

RevueJournal of College of Physicians And Surgeons Pakistan · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésColorectal cancerCancerMedicineOncologyInternal medicineMendelian randomizationMetabolomicsBioinformaticsBiologyGeneticsGenotypeGenetic variantsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: To evaluate the causal relationship between 1,400 metabolites and colorectal and gastric cancer. STUDY DESIGN: Mendelian randomisation study. Place and Duration of the Study: The Affiliated Yantai Yuhuangding Hospital of Qingdao University, Yantai, China, from July to August 2024. METHODOLOGY: Metabolite genome-wide association study (GWAS) data and genetic data from the Canadian Longitudinal Study on Aging (CLSA) as well as the expensive FinnGen project, respectively, were sourced. Suitable instrumental variables were chosen based on their association with metabolites at a genome-wide significance level, thus ensuring a high degree of reliability in the causal inferences drawn. Inverse variance weighting (IVW) was used for initial analysis. Sensitivity analyses were conducted using MR Egger regression and weighted median methods to validate findings and assess potential pleiotropy or bias. RESULTS: Metabolites were included in the study of 8,299 individuals. Gastric cancer included 1,307 cases and 287,137 controls; while colorectal cancer included 6,509 cases and 287,137 controls. The research identified sixty-nine metabolites associated with varying degrees of risk enhancement or mitigation. For gastric cancer, a more focused discovery highlighted two metabolites with significant causal links-associated with increased risk as well as a protective effect. Sensitivity analyses confirmed the validity of these findings. CONCLUSION: By elucidating specific metabolites that exert direct causal effects on colorectal and gastric cancer risk, the study marked a significant advancement in the understanding of the metabolic pathways involved in cancer development. KEY WORDS: Mendelian randomisation, Colorectal cancer, Gastric cancer, Metabolites, Genetic variants, Genome-wide association studies, Causal inference.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,342
Score d'incertitude au seuil0,336

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of College of Physicians And Surgeons PakistanMême sujetGenetic Associations and EpidemiologyTravaux en français237 207