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Enregistrement W4407426548 · doi:10.7554/elife.104797.1.sa1

Reviewer #2 (Public review): Magnetotactic Bacteria Optimally Navigate Natural Pore Networks

2025· peer-review· en· W4407426548 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepeer-review
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGeomagnetism and Paleomagnetism Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesBanff International Research Station for Mathematical Innovation and DiscoveryNational Science Foundation
Mots-clésMagnetotactic bacteriaNatural (archaeology)MagnetosomeBacteriaComputer scienceChemistryGeologyPaleontology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Magnetotactic bacteria swim along geomagnetic field lines to navigate the pore spaces of water-saturated sediment. To understand the physical basis for efficient navigation in confined geometries, we observe the motion of Multicellular Magnetotactic Bacteria through an artificial pore space under an applied magnetic field. Magnetotaxis is fastest when bacteria swim a distance that is of order the pore size in the time required to align with the applied field. A model—in which bacteria deterministically align with the magnetic field and randomly scatter off boundaries—predicts the observed non-monotonic relationship between the drift velocity and applied magnetic field and the value of the maximum drift velocity. A comparison of diverse magnetotactic bacteria shows that the magnetic moments, swimming speeds, and hydrodynamic mobilities of different species covary such that the average speed of magnetotaxis for each species is close to optimal for its natural environment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,030
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,208
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,103
Score d'incertitude au seuil0,344

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0300,208
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,003
Bibliométrie0,0050,004
Études des sciences et des technologies0,0040,002
Communication savante0,0110,006
Science ouverte0,0060,005
Intégrité de la recherche0,0160,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1030,054

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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