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Enregistrement W4407503752 · doi:10.1094/pbiomes-11-24-0113-p

Exploring Diverse Approaches to Iterative Microbiome Passaging in Soil and Plant Systems

2025· article· en· W4407503752 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuePhytobiomes Journal · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensUniversité de MontréalThe Scarborough HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGenome PrairieUniversity of TorontoGovernment of CanadaUniversities Space Research AssociationGovernment of OntarioGenome Canada
Mots-clésMicrobiomeComputational biologyBiologyBiotechnologyComputer scienceBiochemical engineeringBioinformaticsEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Efficient use of managed land depends on our ability to optimize relevant processes (e.g., crop growth) in that space. Microbial activities are critical to this goal, given their enormous contributions to biogeochemical flux and organismal health. Unfortunately, we still cannot predictably harness their potential in the same way that we can introduce nutrients or manipulate plant composition, for example. In recent years, iterative microbiome passaging has been investigated as an approach for capturing and optimizing groups of microorganisms that contribute additively to functions of interest, such as plant growth promotion or litter decomposition. Early trials show that this approach can alter microbiome function, but functional gains can seem almost stochastic, unlike archetypes of breeding within individual lineages. In this Perspective, we highlight the importance of continuing to explore diverse approaches to iterative microbiome passaging in soil and plant systems, given our limited knowledge about how this process works. There is no single “best” approach, but experimental design choices can have large impacts on outcomes. Ultimately, we believe that a better understanding of different forms of iterative microbiome passaging will allow us to (i) leverage the power of uncultivated microbes, additive/synergistic microbial contributions, and intermicrobial interactions and (ii) understand how land use choices will shape the functional trajectories of microbiomes through time. [Formula: see text] Copyright © 2025 The Author(s). This is an open access article distributed under the CC BY 4.0 International license .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,512
Score d'incertitude au seuil0,412

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,159
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,085 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle