Characterization of breast samples via basis function methods using differential linear x-ray scattering coefficients
Notice bibliographique
Résumé
Despite advances in imaging and histology, discrepancies and sampling errors persist, prompting research into complementary methods like Wide Angle X-ray Scatter (WAXS) for improved cancer diagnosis. This study was focused on extracting an estimation of the differential linear x-ray scattering coefficient (μs) of stroma tissue and then using it in a three basis function method to estimate the make up of composite breast tissue samples. This work made use of μs of malignant, benign, and fibroglandular tissues measured by Kidane et al. Phys. Med. Biol. 44 (1999) for extraction of μs stroma. Using histological data from Kidane et al., μs values for stroma were extracted from (i) malignant samples composed of malignant epithelium and stroma (ii) benign samples: benign epithelium and stroma, and (iii) fibroglandular samples: fat and stroma. The cell model by LeClair et al. J. of Med. Imag. 2 (2015) was employed to estimate μs of cells which was used to approximate μs of malignant and benign epithelium. An average value of μs stroma was calculated. Using this μs stroma, the μs cell and a μs fat from Kidane et al., a three-basis function method was applied. The fractional volumes for stroma, cells, and fat denoted by νstr, νcell, νfat, respectively, were calculated using the singular value decomposition (SVD) method. In fact, the three-basis function was reduced to a two-basis function method by the constraint that νstr + νcell + νfat = 1. A momentum transfer range of 0.8nm−1 to 3.2nm−1 was used when fitting Kidane et al. data whereas a range of 0.8nm−1 to 2.5nm−1 was used when fitting of LeClair et al. Med. Phys. 33 (2006) data. For a cancer specimen from LeClair et al. νstr = 0.58, νcell = 0.43, νfat = −0.01, whereas for a benign specimen from Kidane et al. νstr = 0.94, νcell = 0.11, νfat = −0.05. The negative volume coefficients for fat indicate its absence from the samples. Cancerous samples exhibit higher cell content, confirming uncontrolled cell-proliferation as a cancer hallmark, while benign samples primarily reflect increased “fibrous” tissue. The fitting algorithm was effective for characterizing composite breast specimens, with results aligning well with known cancer biology.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».