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Enregistrement W4407574495 · doi:10.1038/s41597-025-04532-9

A chromosome-level genome assembly of Mylabris sibirica Fischer von Waldheim, 1823 (Coleoptera, Meloidae)

2025· article· en· W4407574495 sur OpenAlexaff
Chen‐Hui Shen, Guofeng Yang, Min Tang, Xiaofei Li, Li Zhu, Wei Li, Lin Jin, Deng Pan, Huan‐Huan Zhang, Qing Zhai, Gang Wu, Yan Xiaohong

Notice bibliographique

RevueScientific Data · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBeetle Biology and Toxicology Studies
Établissements canadiensMinistry of Agriculture
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyChromosomeZoologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mylabris sibirica is a hypermetamorphic insect that primarily feeds on oilseed rape during the adult stage. However, the limited availability of genomic resources hinders our understanding of the gene function, medical use, and ecological adaptation in M. sibirica. Here, a high-quality chromosome-level genome of M. sibirica was generated by PacBio, Illumina, and Hi-C technologies. Its genome size was 138.45 Mb, with a scaffold N50 of 13.84 Mb and 99.85% (138.25 Mb) of the assembly anchors onto 10 pseudo-chromosomes. BUSCO analysis showed this genome assembly had a high-level completeness of 100% (n = 1,367), containing 1,358 (99.4%) single-copy BUSCOs and 8 (0.6%) duplicated BUSCOs. In addition, a total of 11,687 protein-coding genes and 35.46% (49.10 Mb) repetitive elements were identified. The high-quality genome assembly offers valuable genomic resources for exploring gene function, medical use, and ecology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,023

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
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Résumé présentoui

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