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Enregistrement W4407574841 · doi:10.1371/journal.pone.0318956

No detectable effect of urbanization on genetic drift or gene flow in specialist herbivorous insects of milkweed

2025· article· en· W4407574841 sur OpenAlexafffundabout
Lindsay S. Miles, Elizabeth J. Carlen, Zain Nassrullah, Jason Munshi‐South, Marc T. J. Johnson

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanada Research Chairs
Mots-clésBiological dispersalGenetic diversityGene flowBiologyEcologyPopulationUrbanizationGenetic driftHerbivoreGenetic structureDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Urbanization is hypothesized to isolate populations and restrict dispersal, leading to reduced genetic diversity and increased genetic differentiation. We tested this hypothesis in specialist herbivorous insects of milkweed, positing that higher dispersal ability would mitigate the negative effects of urbanization on genetic drift and gene flow, and that these effects would vary with city size. In this study, we collected 383 milkweed insects from urban and rural sites in Toronto, Canada, and five surrounding cities. Using ddRADseq, we generated 145,000 SPNs for monarchs, 10,000 SNPs for beetles, 6,000 SNPs for weevils to quantify genetic diversity, demographic history and population genetic structure. Contrary to our hypotheses, our results indicated no effect of urbanization or dispersal ability on diversity or genetic differentiation. Genetic diversity, measured as π, varied between 0.0013 and 0.0044 across species, with no urban vs. rural component, but with monarchs having >2 X higher diversity compared to beetles and weevils. Similarly, genetic differentiation was generally low, FST varying between 0.01 and 0.28, but there are no consistent trends among urban vs. rural samples for any of the three species. However, demographic analyses revealed a consistent decline in effective population size for all three sampled species, beginning around the last glacial maximum and intensifying over the past 1,000 years. Our findings suggest that both urbanization and dispersal ability have not been a major factor in reducing gene flow or increasing genetic drift among milkweed's herbivorous insect populations. Instead, historical events such as climatic change since the last glacial maximum, and large-scale anthropogenic disturbance in general, have had a more pronounced impact on demography. These results highlight the importance of considering the combined effects of natural and anthropogenic long-term historical processes when studying population genetics in the context of urbanization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,088
Score d'incertitude au seuil0,174

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2025
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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