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Enregistrement W4407586707 · doi:10.1101/2025.02.13.638176

Additive effects on craniofacial development upon conditional ablation of PDGFR <i>α</i> and SHP2 in the mouse neural crest lineage

2025· preprint· en· W4407586707 sur OpenAlexfundno aff
Jessica Johnston, Elliott P. Brooks, Katherine A. Fantauzzo

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Tyrosine Phosphatases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAnschutz Medical Campus, University of ColoradoYork University
Mots-clésNeural crestCraniofacialLineage (genetic)BiologyAblationCrestInternal medicineCell biologyGeneticsMedicineEmbryoGenePhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Activity of the receptor tyrosine kinase PDGFRα and the tyrosine phosphatase SHP2 are critical for vertebrate craniofacial development. We sought to determine the effect of SHP2 binding to PDGFRα via phenotypic and biochemical analyses of an allelic series of mouse embryos with combined loss of both proteins in the neural crest lineage. Results: We demonstrated that SHP2 preferentially binds PDGFRα/α homodimers among the three PDGFR dimers. Analysis of allelic series mutant embryos revealed increased cell death in the lateral nasal and maxillary processes at E10.5, variably penetrant facial blebbing, facial hemorrhaging, midline clefting and loss of the mandibular region at E13.5, and widespread craniofacial bone and cartilage defects at birth. Further, we showed that loss of SHP2 leads to increased phosphorylation of PDGFRα and the downstream effector Erk1/2 in E10.5 allelic series mutant embryo lysates. Conclusions: Together, our findings demonstrate additive effects on craniofacial development upon conditional ablation of PDGFRα and SHP2 in the mouse neural crest lineage and indicate that SHP2 may negatively and positively regulate PDGFRα signaling through distinct mechanisms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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