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Enregistrement W4407600991 · doi:10.12794/metadc1404563

Lipogenic Proteins in Plants: Functional Homologues and Applications

2018· dissertation· en· W4407600991 sur OpenAlexfundno aff
Yingqi Cai

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant biochemistry and biosynthesis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesDivision of Integrative Organismal SystemsBiological and Environmental ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAgricultural Research ServiceMichigan State UniversityCollege of Engineering, Michigan State UniversityOffice of ScienceHoward Hughes Medical InstituteU.S. Department of AgricultureU.S. Department of EnergyNational Science Foundation
Mots-clésComputational biologyChemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Although cytoplasmic lipid droplets (LDs) are the major reserves for energy-dense neutral lipids in plants, the cellular mechanisms for packaging neutral lipids into LDs remain poorly understood. To gain insights into the cellular processes of neutral lipid accumulation and compartmentalization, a necessary step forward would be to characterize functional roles of lipogenic proteins that participate in the compartmentalization of neutral lipids in plant cells. In this study, the lipogenic proteins, Arabidopsis thaliana SEIPIN homologues and mouse (Mus Musculus) fat storage-inducing transmembrane protein 2 (FIT2), were characterized for their functional roles in the biogenesis of cytoplasmic LDs in various plant tissues. Both Arabidopsis SEIPINs and mouse FIT2 supported the accumulation of neutral lipids and cytoplasmic LDs in plants. The three Arabidopsis SEIPIN isoforms play distinct roles in compartmentalizing neutral lipids by enhancing the numbers and sizes of LDs in various plant tissues and developmental stages. Further, the potential applications of Arabidopsis SEIPINs and mouse FIT2 in engineering neutral lipids and terpenes in plant vegetative tissues were evaluated by co-expressing these and other lipogenic proteins in Nicotiana benthamiana leaves. Arabidopsis SEIPINs and mouse FIT2 represent effective tools that may complement ongoing strategies to enhance the accumulation of desired neutral lipids and terpenes in plant vegetative tissues. Collectively, our findings in this study expand our knowledge of the broader cellular mechanisms of LD biogenesis that are partially conserved in eukaryotes and distinct in plants and suggest novel targets that can be introduced into plants to collaborate with other factors in lipid metabolism and elevate oil content in plant tissues.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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