Ex vivo T-lymphopoiesis assays assisting corrective treatment choice for genetically undefined T-lymphocytopenia
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Newborn screening for severe combined immunodeficiency promotes early diagnosis and timely treatment, improving clinical outcomes. Selective T-lymphocytopaenia is found both in haematopoietic cell-intrinsic and thymic stromal cell-intrinsic defects, including congenital athymia which is associated with a T-B + NK + immunophenotype. Without a molecular diagnosis, it is challenging to determine whether haematopoietic cell transplantation (HCT) or thymus transplantation ought to be performed. Ex vivo T-lymphocyte differentiation assays have been proposed to assist clinical decision-making for genetically undefined T-lymphocytopaenic patients by assessing the intrinsic potential of their haematopoietic progenitors to differentiate into mature T-lymphocytes. We investigated 18 T-lymphocytopaenic patients, including 12 patients awaiting first-line treatment and 6 patients with failed immune reconstitution after previous HCT or thymus transplantation. Whilst early developmental blocks in ex vivo T-lymphopoiesis indicated haematopoietic cell-intrinsic defects, successful differentiation of mature T-lymphocytes required careful interpretation, in conjugation with clinical status and presentation, immunophenotyping, and available genetic investigations. 5 patients were referred for HCT and 12 for thymus transplantation. 12/18 patients proceeded to treatment with successful immune reconstitution in 4/5 patients after HCT and 4/7 after thymus transplantation, the latter including two patients previously treated with HCT. Two treated patients died, either after HCT or after thymus transplantation, due to pre-existing complications, and two patients have yet to show immune reconstitution seven months and one year after thymus transplantation respectively. Overall, we conclude that including ex vivo T-lymphocyte differentiation assays in the diagnostic pathway for genetically undefined T-lymphocytopaenia improves patient outcomes by facilitating corrective treatment choice between HCT and thymus transplantation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».