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Enregistrement W4407642482 · doi:10.3390/applbiosci4010011

SALM: A Unified Model for 2D and 3D Region of Interest Segmentation in Lung CT Scans Using Vision Transformers

2025· article· en· W4407642482 sur OpenAlexafffund
Hadrien T. Gayap, Moulay A. Akhloufi

Notice bibliographique

RevueApplied Biosciences · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiomics and Machine Learning in Medical Imaging
Établissements canadiensUniversité de Moncton
Organismes subventionnairesAlliance de recherche numérique du CanadaNew Brunswick Innovation Foundation
Mots-clésSegmentationTransformerComputer visionArtificial intelligenceComputer scienceEngineeringElectrical engineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Accurate segmentation of Regions of Interest (ROI) in lung Computed Tomography (CT) is crucial for early lung cancer diagnosis and treatment planning. However, the variability in size, shape, and location of lung lesions, along with the complexity of 3D spatial relationships, poses significant challenges. In this work, we propose SALM (Segment Anything in Lung Model), a deep learning model for 2D and 3D ROI segmentation. SALM leverages Vision Transformers, proposing an adaptation of positional encoding functions to effectively capture spatial relationships in both 2D slices and 3D volumes using a single, unified model. Evaluation on the LUNA16 dataset demonstrated strong performance in both modalities. In 2D segmentation, SALM achieved a Dice score of 93% on 124,662 slices. For 3D segmentation using 174 3D images from the same dataset, SALM attained a Dice score of 81.88%. We also tested SALM on an external database (PleThora) on a subset of 255 pulmonary CT from diseased patients, where it achieved a Dice score of 78.82%. These results highlight SALM’s ability to accurately segment lung ROI in both 2D and 3D, demonstrating its potential to improve the accuracy and efficiency of computer-aided diagnosis for lung cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,347
Écart entre enseignants0,312 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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