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Enregistrement W4407669026 · doi:10.3389/fpls.2024.1395952

Applications of synchrotron light in seed research: an array of x-ray and infrared imaging methodologies

2025· article· en· W4407669026 sur OpenAlexafffundabout
Paula Ashe, Kaiyang Tu, Jarvis Stobbs, James J. Dynes, Miranda Vu, Hamid Shaterian, Sateesh Kagale, Karen Tanino, Janitha P.D. Wanasundara, Sally Vail, Chithra Karunakaran, Teagen D. Quilichini

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Plant Science · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhotosynthetic Processes and Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of SaskatchewanAgriculture and Agri-Food CanadaCanadian Light Source (Canada)National Research Council CanadaSaskatchewan Research Council (Canada)
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchMcMaster UniversityCanadian Light Source
Mots-clésSynchrotronEndospermSativumMaterials scienceBotanyBiologyPhysicsOptics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Synchrotron radiation (SR) provides a wide spectrum of bright light that can be tailored to test myriad research questions. SR provides avenues to illuminate structure and composition across scales, making it ideally suited to the study of plants and seeds. Here, we present an array of methodologies and the data outputs available at a light source facility. Datasets feature seed and grain from a range of crop species including Citrullus sp. (watermelon), Brassica sp. (canola), Pisum sativum (pea), and Triticum durum (wheat), to demonstrate the power of SR for advancing plant science. The application of SR micro-computed tomography (SR-µCT) imaging revealed internal seed microstructures and their three-dimensional morphologies in exquisite detail, without the need for destructive sectioning. Spectroscopy in the infrared spectrum probed sample biochemistry, detailing the spatial distribution of seed macronutrients such as lipid, protein and carbohydrate in the embryo, endosperm and seed coat. Methods using synchrotron X-rays, including X-ray absorption spectroscopy (XAS) and X-ray fluorescence (XRF) imaging revealed elemental distributions, to spatially map micronutrients in seed subcompartments and to determine their speciation. Synchrotron spectromicroscopy (SM) allowed chemical composition to be resolved at the nano-scale level. Diverse crop seed datasets showcase the range of structural and chemical insights provided by five beamlines at the Canadian Light Source, and the potential for synchrotron imaging for informing plant and agricultural research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,004
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,331
Écart entre enseignants0,309 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2025
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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