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Enregistrement W4407684410 · doi:10.1038/s41467-025-56766-1

Eukaryotic Elongation Factor 2 Kinase EFK-1/eEF2K promotes starvation resistance by preventing oxidative damage in C. elegans

2025· article· en· W4407684410 sur OpenAlexafffund
Junran Yan, Forum Bhanshali, Chiaki Shuzenji, Tsultrim T. Mendenhall, Shane K. B. Taylor, Glafira Ermakova, Xuanjin Cheng, Pamela Bai, Gahan Diwan, Donna Seraj, Joel N. Meyer, Poul H. Sorensen, Jessica H. Hartman, Stefan Taubert

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreEmergent BioSolutions (Canada)BC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Environmental Health SciencesBC Cancer AgencyCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of California, San DiegoNational Institutes of HealthFaculty of Medicine, University of British ColumbiaU.S. Department of Health and Human ServicesCanada Research ChairsUniversities Space Research AssociationKwantlen Polytechnic UniversityBC Children’s Hospital FoundationBC Children's HospitalProvincial Health Services AuthorityRoswell Park Cancer InstituteGovernment of CanadaConquer Cancer Foundation
Mots-clésCell biologyElongationStarvationOxidative damageElongation factorOxidative phosphorylationOxidative stressCaenorhabditis elegansKinaseBiologyChemistryBiochemistryGeneMaterials science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cells and organisms frequently experience starvation. To survive, they mount an evolutionarily conserved stress response. A vital component in the mammalian starvation response is eukaryotic elongation factor 2 (eEF2) kinase (eEF2K), which suppresses translation in starvation by phosphorylating and inactivating the translation elongation driver eEF2. C. elegans EFK-1/eEF2K phosphorylates EEF-2/eEF2 on a conserved residue and is required for starvation survival, but how it promotes survival remains unclear. Surprisingly, we found that eEF2 phosphorylation is unchanged in starved C. elegans and EFK-1’s kinase activity is dispensable for starvation survival, suggesting that efk-1 promotes survival via a noncanonical pathway. We show that efk-1 upregulates transcription of DNA repair pathways, nucleotide excision repair (NER) and base excision repair (BER), to promote starvation survival. Furthermore, efk-1 suppresses oxygen consumption and ROS production in starvation to prevent oxidative stress. Thus, efk-1 enables starvation survival by protecting animals from starvation-induced oxidative damage through an EEF-2-independent pathway. Cells survive starvation by activating protective pathways. Here, the authors describe that kinase EFK-1/eEF2K defends against oxidative damage in long term starvation in C. elegans independently from its kinase activity and translation regulation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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