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Enregistrement W4407701628 · doi:10.1200/jco.2025.43.5_suppl.62

Reflexive paired somatic and germline testing at time of medical oncology referral in mCSPC: Impact on timely treatment.

2025· article· en· W4407701628 sur OpenAlexaff
Richard Gagnon, Andrew Attwell, Adam Fundytus, Joanna Vergidis, Sunil Parimi, Eric Sonke, Nimira Alimohamed, Steven Yip, Corinne Maurice Dror, Kim N., Madison Hinkley, Jean‐Michel Lavoie

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaUniversity of CalgaryBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineGermlineReferralSomatic cellGermline mutationOncologyInternal medicineFamily medicineMutationGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

62 Background: Use of PARP inhibitors (PARPi) improves outcomes in patients with metastatic castrate-resistant prostate cancer (mCRPC) harboring germline or somatic homologous recombination repair (HRR) mutations. To ensure timely PARPi initiation, genetic results should be available at castrate resistance, with testing initiated in the metastatic castration-sensitive (mCSPC) setting. Relying on ad hoc, provider-initiated testing risks biomarker unavailability when treatment decisions are made, leading to suboptimal therapies. This study evaluates a program of reflexive paired germline and tumor testing for mCSPC patients at medical oncology referral (typically following initial management and androgen deprivation therapy [ADT] by urology or radiation oncology) as a potentially effective time point for genetic testing. Methods: This was a single cancer centre, retrospective review of mCSPC patients offered simultaneous germline and tumor tissue next-generation sequencing at medical oncology referral. We examined test completion rates, timing of results relative to key disease timepoints (ADT initiation, first-line mCRPC treatment), and the frequency of detected pathogenic mutations. Timing of results was analyzed separately for all patients, those with HRR mutations, and those with timely referrals to medical oncology, defined as <90 days from ADT start. Results: Of 218 mCSPC patients, 212 (97.2%) completed germline or tumor tissue sequencing with interpretable results from at least one assay. Germline results were obtained in 171 patients (78.4%) and tumor tissue results in 194 (88.9%). HRR mutations were detected in 29 patients (13.3%): 15 germline, 10 somatic, and 4 of unknown origin. Median time from ADT initiation to germline and tumor tissue genetic results was 165 and 120 days, respectively. Germline results were available for 144 patients (84.2%) and tumor tissue results for 176 (90.7%) before initiation of first-line mCRPC treatment. Among the 29 patients with identified HRR mutations, 19 (76%) had germline results and 17 (81%) had tumor tissue results before first-line mCRPC treatment. In the subgroup of 175 patients referred to medical oncology within 90 days of ADT initiation, 136 patients (98.6%) had germline results and 148 (99.3%) had tumor tissue results before first-line mCRPC treatment. Conclusions: Reflexive paired genetic testing at medical oncology referral is effective in identifying HRR mutations and optimizing PARPi use based on current mCRPC indications. Ensuring timely patient identification through clear and accessible genetic testing pathways will help maximize therapeutic options for patients with advanced prostate cancer. If PARPi or other targeted agents demonstrate benefit in earlier disease states, this process may need to be shifted further upstream, requiring close multidisciplinary collaboration.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,019
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,019
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,114
Tête enseignante GPT0,494
Écart entre enseignants0,380 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
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