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Enregistrement W4407719902 · doi:10.1158/2159-8290.cd-24-0417

Pan-Cancer Analysis of Oncogenic MET Fusions Reveals Distinct Pathogenomic Subsets with Differential Sensitivity to MET-Targeted Therapy

2025· article· en· W4407719902 sur OpenAlexaff
Christopher A. Febres‐Aldana, Morana Vojnic, Igor Odintsov, Tom Zhang, Ryan Cheng, Catherine Z. Beach, Daniel Lu, Marissa S. Mattar, Andrea Gazzo, Leo Gili, Manju Harshan, Stephen Machnicki, Xiuying Xiao, William W. Lockwood, Xiaoyan Zhou, Qianlan Yao, Alexander Drilon, Natasha Rekhtman, Nameeta Shah, Anqi Li, Zebing Liu, Soo‐Ryum Yang, Monika A. Davare, Marc Ladanyi, Romel Somwar

Notice bibliographique

RevueCancer Discovery · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLiver physiology and pathology
Établissements canadiensBC Cancer AgencyUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésBiologyFusion geneTyrosine kinaseTransmembrane proteinCarcinogenesisContext (archaeology)Cancer researchTransmembrane domainExonCancerReceptor tyrosine kinaseProtein kinase domainGeneticsGeneKinaseSignal transductionReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

MET fusions (MET-F) are oncogenic drivers that remain poorly characterized. Analysis of 56 MET-F-positive tumors from an institutional cohort of 91,119 patients (79,864 DNA sequencing plus 11,255 RNA sequencing) uncovered two forms of MET-F pathobiology. The first group featured 5' partners with homodimerization domains fused in-frame with the MET tyrosine kinase domain, primarily originated from translocations, frequently excluded MET exon 14, mediated oncogenesis through cytoplasmic aggregation and constitutive activation, and were markedly sensitive to MET tyrosine kinase inhibitors (TKI) in preclinical models and patients with lung cancer. The second group lacked partner homodimerization motifs and retained MET transmembrane and extracellular domains. Their pathogenesis involved intrachromosomal rearrangements, resulting in partner selection for promoter hijacking and fusion allele amplification. Membrane-bound fusions were enriched in gliomas with receptor tyrosine kinase co-alterations. We provide a framework to comprehend the heterogeneous landscape of MET-Fs, supporting that fusion oncogenicity and MET TKI sensitivity are determined by structural topology and pathogenomic context. SIGNIFICANCE: MET fusions are primary drivers of tumor growth in multiple tumor types - lung cancer and gliomas - and can be effectively targeted with either type I (crizotinib, capmatinib, tepotinib, and savolitinib) or type II (cabozantinib) MET TKIs, with best responses in tumors harboring fusions with partner homodimerization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,590
Score d'incertitude au seuil0,715

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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