Prevalence, drug resistance and genetic diversity of <i>Candida glabrata</i> in the reproductive tract of pregnant women in Hainan and comparison with global multilocus sequence data
Notice bibliographique
Résumé
This study investigates the prevalence, drug resistance, and genetic diversity of Candida glabrata, a significant non-albicans Candida species, among pregnant women in Hainan, China. We collected 3,806 reproductive tract secretion samples from women with vaginal discomfort and isolated 594 Candida strains, including C. albicans (45.1%), C. glabrata (36.2%), C. dubliniensis (12.2%), C. parapsilosis (2.7%), C. tropicalis (2.7%), and C. krusei (1.2%). Antifungal susceptibility testing showed that 64.5% of the isolates were intermediate or resistant to at least one of four antifungal agents: fluconazole, itraconazole, voriconazole, and amphotericin B. Among 215 C. glabrata isolates, 81.4% were intermediate or resistant to at least one antifungal, with 10% showing resistance to multiple agents. Multilocus sequence typing (MLST) of 52 C. glabrata strains from the reproductive tract, 53 from oral cavities, and 17 from environmental sources revealed 14 sequence types (STs), with six STs shared among these niches, indicating a highly clonal population structure. Comparisons with the global MLST database showed both shared and distinct characteristics among C. glabrata populations in Hainan and other regions, highlighting significant differentiation. We discuss the implications of these findings to the epidemiology and evolution of this pathogen.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».