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Enregistrement W4407758243 · doi:10.1101/2025.02.14.25322307

Adapting the BOADICEA breast and ovarian cancer risk models for the ethnically diverse UK population

2025· preprint· en· W4407758243 sur OpenAlexafffund
Lorenzo Ficorella, Xin Yang, Nasim Mavaddat, Tim Carver, Hend Hassan, Joe Dennis, Jonathan P. Tyrer, Weang-Kee Ho, Soo‐Hwang Teo, Mikael Hartman, Jingmei Li, Mikael Eriksson, Kamila Czene, Per Hall, Tameera Rahman, Andrew Bacon, Steven J. Hardy, Francisca Stutzin Donoso, Stephanie Archer, Jacques Simard, Paul D P Pharoah, Juliet A. Usher‐Smith, Marc Tischkowitz, Douglas F. Easton, Antonis C Antoniou

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Risks and Factors
Établissements canadiensCentre hospitalier universitaire de Québec
Organismes subventionnairesNational University Health SystemMinisterio de Economía y CompetitividadNational Research Foundation SingaporeNIHR Cambridge Biomedical Research CentreEuropean CommissionDepartment of Health and Social CareFondation du cancer du sein du QuébecNational Cancer InstituteNational Medical Research CouncilNational University of SingaporeNational Research FoundationCanadian Institutes of Health ResearchGray FoundationCancer Research UKGovernment of CanadaWellcome TrustNational Institute for Health and Care ResearchGenome Canada
Mots-clésEthnically diverseOvarian cancerBreast cancerPopulationMedicineOncologyGynecologyCancerEnvironmental healthInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background BOADICEA is a widely used algorithm for predicting breast and ovarian cancer risks, using a combination of genetic and lifestyle/environmental risk factors. However, it has largely been developed using data from individuals of White ethnicity. Methods We utilised data from multiple sources to derive estimates for the distributions of risk factors and their effect sizes in major UK ethnic groups (White, Black, South Asian, East Asian, and Mixed). We combined these with ethnicity-specific population cancer incidences to update BOADICEA so that it provides ethnicity-specific risk estimates. We also developed and included a method for deriving adjusted polygenic scores for individuals of mixed genetic ancestry. Results The predicted average absolute risks were smaller in all non-White ethnic groups than in Whites, and the risk distributions were narrower. The proportion of women classified as at moderate or high risk of breast or ovarian cancer, according to national guidelines, was considerably smaller in non-White women. Discussion The updated BOADICEA (v7), available in the CanRisk tool ( www.canrisk.org ), is based on estimates more appropriate for non-White women in the UK. Further validation of the model in prospective studies is required. Considering these findings, risk classification guidelines for non- White women may need to be revised.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,228
Score d'incertitude au seuil0,967

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,053
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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