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Enregistrement W4407766607 · doi:10.1063/5.0250923

Deciphering the molecular mechanism of post-acute sequelae of COVID-19 through comorbidity network analysis

2025· article· en· W4407766607 sur OpenAlexaff
Lue Tian, Eric Yuk Fai Wan, Sze Ling Celine Chui, Shuyu Li, Esther W. Chan, Hao Luo, Ian Chi Kei Wong, Qingpeng Zhang

Notice bibliographique

RevueChaos An Interdisciplinary Journal of Nonlinear Science · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLong-Term Effects of COVID-19
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésComorbidityCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Mechanism (biology)2019-20 coronavirus outbreakSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)MedicineIntensive care medicineVirologyPsychiatryDiseaseInternal medicineOutbreak

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The post-acute sequelae of COVID-19 (PASC) poses a significant health challenge in the post-pandemic world. However, the underlying biological mechanisms of PASC remain intricate and elusive. Network-based methods can leverage electronic health record data and biological knowledge to investigate the impact of COVID-19 on PASC and uncover the underlying biological mechanisms. This study analyzed territory-wide longitudinal electronic health records (from January 1, 2020 to August 31, 2022) of 50 296 COVID-19 patients and a healthy non-exposed group of 100 592 individuals to determine the impact of COVID-19 on disease progression, provide molecular insights, and identify associated biomarkers. We constructed a comorbidity network and performed disease-protein mapping and protein-protein interaction network analysis to reveal the impact of COVID-19 on disease trajectories. Results showed disparities in prevalent disease comorbidity patterns, with certain patterns exhibiting a more pronounced influence by COVID-19. Overlapping proteins elucidate the biological mechanisms of COVID-19's impact on each comorbidity pattern, and essential proteins can be identified based on their weights. Our findings can help clarify the biological mechanisms of COVID-19, discover intervention methods, and decode the molecular basis of comorbidity associations, while also yielding potential biomarkers and corresponding treatments for specific disease progression patterns.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,419
Score d'incertitude au seuil0,699

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,386
Écart entre enseignants0,365 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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