Membranous Nephropathy Target Antigens Display Podocyte-Specific and Non-Specific Expression in Healthy Kidneys
Notice bibliographique
Résumé
Background/Objectives: Autoimmunity towards podocyte antigens causes membranous nephropathy (MN). Numerous MN target antigens (MNTAgs) have been reported, including PLA2R1, THSD7A, NTNG1, TGFBR3, HTRA1, NDNF, SEMA3B, FAT1, EXT1, CNTN1, NELL1, PCDH7, EXT2, PCSK6, and NCAM1, but their podocyte expression has not been thoroughly studied. Methods: We screened CZ CELLxGene single-cell RNA (scRNA) sequence datasets for those of adult, fetal, and mouse kidneys and analyzed the above MNTAgs’ expression. Results: In adult kidneys, most MNTAgs are present in podocytes, except PCSK6 and NCAM1. PLA2R1 is expressed significantly more than other MNTAgs in podocytes and is a major podocyte marker, consistent with PLA2R1 as the dominant MNTAg. Additionally, PLA2R1 is a top-upregulated gene in the podocytes of chronic kidney disease, acute kidney injury, and diabetic nephropathy, indicating its general role in causing podocyte injury. PLA2R1, NTNG1, HTRA1, and NDNF display podocyte-enriched expression along with elevated chromatin accessibility in podocytes, suggesting transcription initiation contributing to their preference expression in podocytes. In the fetal kidney, most MNTAgs are expressed in podocytes. While PLA2R1 is weakly present in podocytes, SEMA3B is abundantly expressed in immature and mature podocytes, supporting SEMA3B as a childhood MNTAg. In mouse kidneys, Thsd7a is the only MNTAg with a prominent level and podocyte-specific expression. Conclusions: Most MNTAgs are present in podocytes in adults and during renal development. In adults, PLA2R1 expression is highly enriched in podocytes and significantly upregulated in multiple kidney diseases accompanied by proteinuria. In mouse kidneys, Thsd7a is specifically expressed in podocytes at an elevated level.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».