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Enregistrement W4407825039 · doi:10.1101/2025.02.17.25322399

VOYAGER: an international consortium investigating the role of human papilloma virus and genetics in oral and oropharyngeal cancer risk and survival

2025· preprint· en· W4407825039 sur OpenAlexafffund
Mark Gormley, Anurag Adhikari, Tom Dudding, Miranda Pring, Katrina Hurley, Gary J. Macfarlane, Παγώνα Λάγιου, Areti Lagiou, Jerry Polesel, Antonio Agudo, Laia Alemany, Wolfgang Ahrens, Claire M. Healy, DI Conway, Cristina Canova, Ivana Holcátová, Lorenzo Richiardi, Ariana Znaor, AF Olshan, Rayjean J. Hung, Geoffrey Liu, Scott V. Bratman, Xiaopeng Zhao, James B. Holt, Ricardo Cortez, Valérie Gaborieau, JD McKay, Tim Waterboer, Paul Brennan, D. Neil Hayes, Brenda Diergaarde, Shama Virani

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHead and Neck Cancer Studies
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreSinai Health SystemLunenfeld-Tanenbaum Research InstitutePublic Health OntarioUniversity Health NetworkUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of Dental and Craniofacial ResearchProgramme Grants for Applied ResearchUniversity of PittsburghEuropean CommissionNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthCancer Research UKCanadian Cancer Society Research InstituteNational Institute for Health and Care ResearchCompagnia di San Paolo
Mots-clésHuman papilloma virusCancerMedicineHuman papillomavirusGeneticsBiologyVirologyCervical cancerInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Head and neck cancer (HNC) is the sixth most common cancer globally. Incidence and survival rates vary significantly across geographic regions and HNC tumor subsites. This is partly due to differences in risk factor exposure, including tobacco smoking, alcohol consumption and human papillomavirus (HPV) infection, alongside detection and treatment strategies. The VOYAGER (human papillomaVirus, Oral and oropharYngeal cAncer GEnomic Research) consortium is a collaboration between five large North American and European studies which generated data on more than 10,000 participants (7,233 cases and 3,297 controls). The primary goal of the collaboration was to improve understanding of the role of HPV and genetic factors in oral cavity and oropharyngeal cancer risk and outcome. Demographic and clinical data collected by the five studies were harmonized, and HPV status was determined for the majority of cases. In addition, almost 1,000 tumors were sequenced to characterize somatic alterations. The resulting comprehensive biomedical resource can be utilized to answer critical outstanding research questions to help improve HNC prevention, early detection, treatment, and surveillance. Highlights VOYAGER is a large harmonized international resource for advancing head and neck cancer research. Comprehensive demographic, clinical and genetic data to support studies of head and neck cancer risk and survival. Standardized data harmonization to enable robust analyses across multiple populations. Long-term follow-up to facilitate the development of prognostic and predictive biomarkers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,043
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,043
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,043
Score d'incertitude au seuil0,229

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0430,043
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0040,007
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0060,002
Science ouverte0,0030,006
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0200,006

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,342
Écart entre enseignants0,306 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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