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Enregistrement W4407868577 · doi:10.1007/s00044-025-03386-5

An evaluation of spirooxindoles as blocking agents of SARS-CoV-2 spike/ACE2 interaction: synthesis, biological evaluation and computational analysis

2025· article· en· W4407868577 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueMedicinal Chemistry Research · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueComputational Drug Discovery Methods
Établissements canadiensStructural Genomics ConsortiumUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesLifeArcAlexander von Humboldt-StiftungBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésBlocking (statistics)ChemistrySpike (software development)Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Coronavirus disease 2019 (COVID-19)Computational biologyVirologyComputer scienceBiologyInternal medicineMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) has gained significant public health attention owing to its devastating effects on lives and livelihoods worldwide. Due to difficult access to vaccines in many developing countries and the inefficiency of vaccines in providing complete protection even with fully vaccinated persons, there remains the need for the development of novel drugs to combat the disease. This study describes the in vitro activity of a library of fifty-five spiro-fused tetrahydroisoquinoline–oxindole hybrids (spirooxindoles) as potential blocking agents of the interaction between the SARS-CoV-2 viral spike and the human angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) receptor, essential for viral transmission. The synthesis was conducted by the Pictet-Spengler condensation of phenethylamine and isatin derivatives, while the screening against spike-ACE2 interaction was done using our previously described AlphaScreen fluorescent assay. The in vitro screening identified compound ( 11j ) as the most active, showing a 50% inhibitory concentration (IC 50 ) of 3.6 μM against SARS-CoV-2 spike/ACE2 interaction. Structure-activity relationships explained via molecular docking studies and the computation of binding free energy of each compound with respect to the spike/ACE2 protein-protein interaction showed that the most active compound possesses a bulky naphthyl group, which addresses voluminous hydrophobic regions of the ACE2 binding site and interacts with the hydrophobic residues of the target. Therefore, these compounds could be potentially useful in searching for SARS-CoV-2 spike/ACE2 interaction blocking agents.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,013
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,489
Score d'incertitude au seuil0,504

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0130,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,312
Tête enseignante GPT0,551
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle