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Enregistrement W4407873728 · doi:10.7326/annals-24-02189

Development of Prompt Templates for Large Language Model–Driven Screening in Systematic Reviews

2025· article· en· W4407873728 sur OpenAlexaff
Christian Cao, Jason C. Sang, Rohit Arora, David Chen, Robert Kloosterman, Milena Cecere, Jaswanth Gorla, Richard Saleh, Ian R. Drennan, Bijan Teja, Michael G. Fehlings, Paul E. Ronksley, Alexander A. C. Leung, Dany E. Weisz, Mairead Whelan, D. B. Emerson, Rahul K. Arora, Niklas Bobrovitz

Notice bibliographique

RevueAnnals of Internal Medicine · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueArtificial Intelligence in Healthcare and Education
Établissements canadiensSouth Health CampusVector InstituteHealth Sciences CentreSunnybrook Health Science CentreUniversity of TorontoSt. Michael's HospitalUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineSystematic reviewTemplateIntensive care medicineMEDLINEMedical physicsProgramming languageComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Systematic reviews (SRs) are hindered by the initial rigorous article screen, which delays access to reliable information synthesis. OBJECTIVE: To develop generic prompt templates for large language model (LLM)-driven abstract and full-text screening that can be adapted to different reviews. DESIGN: Diagnostic test accuracy. SETTING: 48 425 citations were tested for abstract screening across 10 SRs. Full-text screening evaluated all 12 690 freely available articles from the original search. Prompt development used the GPT4-0125-preview model (OpenAI). PARTICIPANTS: None. MEASUREMENTS: Large language models were prompted to include or exclude articles based on SR eligibility criteria. Model outputs were compared with original SR author decisions after full-text screening to evaluate performance (accuracy, sensitivity, and specificity). RESULTS: Optimized prompts using GPT4-0125-preview achieved a weighted sensitivity of 97.7% (range, 86.7% to 100%) and specificity of 85.2% (range, 68.3% to 95.9%) in abstract screening and weighted sensitivity of 96.5% (range, 89.7% to 100.0%) and specificity of 91.2% (range, 80.7% to 100%) in full-text screening across 10 SRs. In contrast, zero-shot prompts had poor sensitivity (49.0% abstract, 49.1% full-text). Across LLMs, Claude-3.5 (Anthropic) and GPT4 variants had similar performance, whereas Gemini Pro (Google) and GPT3.5 (OpenAI) models underperformed. Direct screening costs for 10 000 citations differed substantially: Where single human abstract screening was estimated to require more than 83 hours and $1666.67 USD, our LLM-based approach completed screening in under 1 day for $157.02 USD. LIMITATIONS: Further prompt optimizations may exist. Retrospective study. Convenience sample of SRs. Full-text screening evaluations were limited to free PubMed Central full-text articles. CONCLUSION: A generic prompt for abstract and full-text screening achieving high sensitivity and specificity that can be adapted to other SRs and LLMs was developed. Our prompting innovations may have value to SR investigators and researchers conducting similar criteria-based tasks across the medical sciences. PRIMARY FUNDING SOURCE: None.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,251
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,587
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,749
Score d'incertitude au seuil0,924

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,2510,587
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0040,004
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,009
Bibliométrie0,0130,009
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0060,007
Science ouverte0,0040,008
Intégrité de la recherche0,0030,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0210,007

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,374
Tête enseignante GPT0,529
Écart entre enseignants0,155 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
DomaineMéthodes
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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