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Enregistrement W4407875310 · doi:10.3390/vaccines13030219

Which Proteins? The Challenge of Identifying the Protective Antigens for Next-Generation Capripoxvirus Vaccines

2025· review· en· W4407875310 sur OpenAlexaff
Mahder Teffera, Hani Boshra, Timothy R. Bowden, Shawn Babiuk

Notice bibliographique

RevueVaccines · 2025
Typereview
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiquePoxvirus research and outbreaks
Établissements canadiensUniversity of ManitobaCanadian Food Inspection Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVirologyImmunogenicityAntigenBiologyVaccinationImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sheeppox, goatpox, and lumpy skin disease continue to negatively impact the sheep, goat, and cattle industries in countries where these diseases are present and threaten to spread into new regions. Effective vaccines are available for disease control and eradication. However, commercial vaccines are based on live attenuated virus isolates and therefore it is not currently possible to differentiate between infected and vaccinated animals (DIVA), which severely limits the use of these vaccines in countries that are free from disease and at risk of an incursion. The development of next-generation vaccines, including recombinant protein, viral-vectored, and mRNA, has been limited due to the lack of understanding of the protective antigen(s) of capripoxviruses. The complexity of capripoxviruses, with up to 156 open reading frames, makes the identification of protective antigen(s) difficult. This paper identifies the most promising antigens by first considering the membrane-associated proteins and then further selecting proteins based on immunogenicity and their role in immunity by comparing them to known orthopoxvirus homologues. From the 156 potential antigens, 13 have been identified as being the most likely to be protective. Further evaluation of these proteins, as immunogens, would be required to identify the optimal combination of immunodominant antigen(s) for the development of next-generation capripoxvirus vaccines.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,984
Score d'incertitude au seuil0,986

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,123
Tête enseignante GPT0,360
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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