Genetic diversity of <i>Colletotrichum siamense</i> causing mango anthracnose in the state of Jalisco, Mexico, based on ISSR markers
Notice bibliographique
Résumé
Anthracnose caused by species of the genus Colletotrichum is a significant threat to mango production worldwide. Recently, an increase in preharvest anthracnose has been observed in commercial orchards in Jalisco, Mexico. This study aimed to identify the causal agent and assess its genetic diversity. A total of 51 mango fruits exhibiting anthracnose symptoms, including dark, hard, and dry lesions, were collected from five commercial orchards across three municipalities in Jalisco. Of 80 fungal isolates recovered, 64 were identified as Colletotrichum spp. with the phylogenetic analysis confirming these isolates as C. siamense (62 isolates) and C. asianum (2 isolates). Pathogenicity tests on mango fruits and leaves reproduced the characteristic anthracnose symptoms. To investigate intraspecific genetic diversity, 62 C. siamense isolates were analyzed using ISSR markers, revealing 93 DNA bands and 59 multilocus genotypes, with 58.87% polymorphism and an expected heterozygosity of 0.319. This is the first report of C. asianum and C. siamense causing preharvest anthracnose on mangoes in Jalisco. The findings also demonstrate substantial genetic diversity within C. siamense, which can be grouped into two distinct clusters. These results provide valuable insights for mango producers and extension services in developing targeted strategies to manage anthracnose.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».