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Enregistrement W4407925257 · doi:10.1101/2025.02.20.639325

Linking molecular pathways and islet cell dysfunction in human type 1 diabetes

2025· preprint· en· W4407925257 sur OpenAlexaff
Theodore dos Santos, Xiao Qing Dai, Robert C. Jones, Aliya F Spigelman, Hannah M Mummey, Jessica Ewald, Cara E. Ellis, James Lyon, Nancy Smith, Austin Bautista, Jocelyn E. Manning Fox, Norma Neff, Angela M. Detweiler, Michelle Tan, Rafael Arrojo e Drigo, Jianguo Xia, Joan Camuñas-Soler, Kyle J. Gaulton, Stephen R. Quake, Patrick E. MacDonald

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic function and diabetes
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésmTORC1BiologyCell biologyDownregulation and upregulationIsletSignal transductionTranscriptomeImmune systemImmunologyEndocrinologyInsulinPI3K/AKT/mTOR pathwayGene expressionGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary Type 1 diabetes (T1D) is characterized by the autoimmune destruction of most insulin-producing β-cells, along with dysregulated glucagon secretion from pancreatic α-cells. We conducted an integrated analysis that combines electrophysiological and transcriptomic profiling, along with machine learning, of islet cells from T1D donors to investigate the mechanisms underlying their dysfunction. Surviving β-cells exhibit altered electrophysiological properties and transcriptomic signatures indicative of increased antigen presentation, metabolic reprogramming, and impaired protein translation. In α-cells, we observed hyper-responsiveness and increased exocytosis, which are associated with upregulated immune signaling, disrupted transcription factor localization and lysosome homeostasis, as well as dysregulation of mTORC1 complex signaling. Notably, key genetic risk signals for T1D were enriched in transcripts related to α-cell dysfunction, including MHC class I which were closely linked with α-cell dysfunction. Our data provide novel insights into the molecular underpinnings of islet cell dysfunction in T1D, highlighting pathways that may be leveraged to preserve residual β-cell function and modulate α-cell activity. These findings underscore the complex interplay between immune signaling, metabolic stress, and cellular identity in shaping islet cell phenotypes in T1D. Highlights Surviving β-cells in T1D show disrupted electrical function linked to metabolic reprogramming and immune stress. Transcripts associated with α-cell dysfunction are enriched in genetic risk alleles for T1D. Upregulated MHC class I and impaired nuclear localization of key transcription factors associate with α-cell dysfunction in T1D. T1D α-cells exhibit increased hyper-activity, lysosomal imbalance and impaired mTORC1 signaling, which promotes dysregulated glucagon secretion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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